阅读结构步骤

read-structure-step的Python项目详细描述


读取结构步骤

Build StatusCode CoverageCode QualityDocumentation StatusUpdates for DependenciesPyPi VERSION

说明

一个用于读取计算化学中常见格式的seam插件。当前版本 使用OpenBabel作为引擎来解析各种格式,如PDB、Mol2或XYZ和transform 将它们转换为seam结构格式,以便在seam流程图中进一步使用。在

特点

  • 强调易用性和简单性。公共接口由单个函数组成。在
  • 自动文件类型识别。在
  • OpenBabel作为一个解析格式的引擎,但是其他引擎可以很容易地实现。在
  • 易于扩展到新格式。在
  • 当前对PDB、Mol2和XYZ文件的支持。在
  • 自由软件:BSD-3条款
  • 文档:https://read-structure-step.readthedocs.io。在

示例

importread_structure_stepseamm_structure=read_structure_step.read("spc.xyz")

学分

此包是用Cookiecuttermolssi-seamm/cookiecutter-seamm-plugin项目模板创建的。在

由分子科学软件研究所(MolSSI)开发, 它从 授予ACI-1547580

历史

  • PyPI的第一个版本。在

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