Quantiphyse是一个体积医学成像数据的数据浏览和分析平台
quantiphyse的Python项目详细描述
数量
3D/4D数据和PK建模查看器
概述
该查看器提供了建模和分析3D/4D体积数据（主要是MRI数据）的工具。
核心功能：
- 加载/保存3d/4d nifti文件
- 分析工具，包括单/多体素分析和数据比较
- 一般处理，包括平滑、重采样、聚类
通过插件提供的功能
- 注册，运动校正
- dce、asl、dsc和cest mri的建模工具
- 集成选定的FSL工具
请参见：http://quantiphyse.readthedocs.org/en/latest/" rel="nofollow">http://quantiphyse.readthedocs.org/en/latest/获取完整文档。
安装
如果您已经安装了python，那么quantiphyse可以在pypi上使用：
pip install quantiphyse
注意，cython和numpy必须已经安装，才能构建核心扩展。 我们希望能够尽快为Windows和Mac提供轮子，以避免出现这种情况。
Quantiphyse的主要版本可通过牛津大学创新软件获得 存储（https://process.innovation.ox.ac.uk/software" rel="nofollow">https://process.innovation.ox.ac.uk/software）。如果你对商业许可感兴趣 你应该先联系欧伊。oui持有的包没有外部依赖项 可以安装在Windows、Mac和Linux上。
许可证
Quantiphyse在学术（非商业）许可下免费提供。参见许可证文件
详细信息，如有兴趣，请联系OUI
商业许可。
从源代码运行（针对开发人员）
仅当您对进一步开发软件感兴趣时，才建议从源代码运行。
- 安装依赖项：
python依赖项的列表在 例如： 脚本packaging/build.py用于以压缩归档文件的形式构建冻结的分发包（ 在OSX上从源代码安装并不有趣。主要问题是qt，因为所需的版本（4.8）是
已弃用且难以正确安装。 我在使用anaconda和使用conda工具安装pyside方面取得了最大的成功。这应该会带来合适的qt版本。 当前问题可以在github问题跟踪程序上查看（https://github.com/ibme-qubic/quantiphyse/issues） python 3（目前还没有完全测试，但应该基本正常） 视图类的重构 MOCO/注册 三维视图 添加Jola的纹理分析，无论它是什么，听起来都很酷 pk建模验证 简化/重写通用fabber接口 通过交换不显示的数据来提高内存使用率？ 在roi中处理的所有小部件都应该与
ROI，而不是整个图像。 使用nibabel支持其他文件格式。 添加半定量度量值 模拟工具 欢迎加入QQ群-->： 979659372
requirements.txt中
pip install -r requirements.txt
python setup.py build_ext--就地
python qp.py包装
tar.gz或.zip）
以及依赖于平台的包（deb，msi或dpg）。它应该自动运行，但是您可能需要输入sudo密码。
在Linux上，以便构建一个deb包。--snapshot选项将从包文件名中删除版本号，以便您无需更改链接URL即可将其提供给下载。--maxi选项构建一个包含选定插件的包，假设这些插件已下载 OSX
待办事项列表
问题跟踪程序
路线图
v0.6（2018年6月发布）
v0.8（目标2019年3月）
v1.0（目标2019年6月）
对未来的模糊计划
迁移到Pyside2
推荐PyPI第三方库
