qsiprep为预处理和重建q-空间图像构建工作流
qsiprep的Python项目详细描述
qsiprep大量借用fmriprep来构建预处理q空间图像的工作流。 如扩散光谱图像(DSI)、多壳层HARDI和压缩传感DSI(CS-DSI)。 它利用dipy和蚂蚁实现了一种新的高b值头部运动校正方法 使用Q空间方法(如3dshore)迭代生成每个人的头部运动目标图像 梯度方向和强度。
由于qsiprep使用fmriprep工作流构建策略,它还可以生成方法 样板和质量检查图。
用户还可以重建定向分布函数(ODF)、光纤定向 分布(FOD)和进行牵引成像,估计各向异性标量和连通性 使用dipy、mrtrix和dsi studio结合使用基于json的管道进行估算 规范。
[文档qsiprep.org]