python的密码子使用表，来自kazusa.or.jp
python_codon_tables的Python项目详细描述
python密码子表图片：https://travis-ci.org/edinburgh-genome-foundry/codon-usage-tables.svg？branch=master
：target:https://travis ci.org/edinburgh genome foundry/codon usage tables
为python 3+提供密码子使用表作为字典。
《黑色素胃病》*
-*大肠杆菌*
-*G.Gallus*
-*H.Sapienss*
-*M.M.M.M.M.M.M.M.M.M.M.S.S.S.S.S.S.S.S.M.M.M.M.S.S.M.S.S.M.S.S.S.S.M.M.M.M.M.S.M.M.M.S.M.M.M.S.S.S.S.S.S.S.S.S.cerevisiaea*
<所有表格均来自于“kazusa.or.jp或.jp http://www.kazusa.or.br/>…编码：
国际DNA序列数据库中列出的密码子使用情况：
2000年的状态。
Nakamura，Y.，Gojobori，T.和Ikemura，T.（2000）NUCL.酸资源28，292.
代码：：python
import python_codon_tables as pct
\pct.available_-codon_-tables_-names）
按名称加载一个表
table=pct.get_-codons_-table_-subtilis_1423年‘
print（table['t']['aca']]]]\；return0.4
print（table['''''']['taa']]>print（table['''''']['taa']]]<0.61
/>按按Tax加载一个表加载一个表（如果不加载一个表，它将从互联网上下载br/>内置表
table=pct.get_codons_表（1423）
print（table['t'['t']['aca']]；返回0.4
print（table[''''']['taa']]；返回0.61
；一次性加载所有内置表
codons_tables=pct.get_所有可用的密码子表
prinprin（codons_codons_codons_所有可用的密码子表
prinprin（codons_表['c''u elegans'''['c''u elegans'''''''''''''aca']]]]]]]；返回0 6239']['l']['cta']）返回0.09
-请注意，默认情况下，这些表使用核苷酸t而不是u。使用
`` get_codons_table（'e_coli'，replace____=false）``将使我们成为我们。
-在`` get_codons_table`中，您还可以提供一个“速记”符号
`` b_subtilis`，它将自动扩展到“b_subtilis_1423”，因为
它出现在内置表中（自行承担风险！）
贡献
——
本项目由Zulko在爱丁堡基因组铸造厂启动，并在“Github<；https://github.com/edinburgh genome foundry/codon usage tables>；”上发布，获得公共域许可证（不提供任何保证，如果不确定，请与其他来源交叉检查密码子使用情况）。如果您想到更常用的物种，请随意添加其他表格。
安装
----
通过PIP：
……代码：：bash
pip安装python_codon_tables
手册：
…代码：：bash
（sudo）python setup.py install
：target:https://travis ci.org/edinburgh genome foundry/codon usage tables
为python 3+提供密码子使用表作为字典。
《黑色素胃病》*
-*大肠杆菌*
-*G.Gallus*
-*H.Sapienss*
-*M.M.M.M.M.M.M.M.M.M.M.S.S.S.S.S.S.S.S.M.M.M.M.S.S.M.S.S.M.S.S.S.S.M.M.M.M.M.S.M.M.M.S.M.M.M.S.S.S.S.S.S.S.S.S.cerevisiaea*
<所有表格均来自于“kazusa.or.jp或.jp http://www.kazusa.or.br/>…编码：
国际DNA序列数据库中列出的密码子使用情况：
2000年的状态。
Nakamura，Y.，Gojobori，T.和Ikemura，T.（2000）NUCL.酸资源28，292.
代码：：python
import python_codon_tables as pct
\pct.available_-codon_-tables_-names）
按名称加载一个表
table=pct.get_-codons_-table_-subtilis_1423年‘
print（table['t']['aca']]]]\；return0.4
print（table['''''']['taa']]>print（table['''''']['taa']]]<0.61
/>按按Tax加载一个表加载一个表（如果不加载一个表，它将从互联网上下载br/>内置表
table=pct.get_codons_表（1423）
print（table['t'['t']['aca']]；返回0.4
print（table[''''']['taa']]；返回0.61
；一次性加载所有内置表
codons_tables=pct.get_所有可用的密码子表
prinprin（codons_codons_codons_所有可用的密码子表
prinprin（codons_表['c''u elegans'''['c''u elegans'''''''''''''aca']]]]]]]；返回0 6239']['l']['cta']）返回0.09
-请注意，默认情况下，这些表使用核苷酸t而不是u。使用
`` get_codons_table（'e_coli'，replace____=false）``将使我们成为我们。
-在`` get_codons_table`中，您还可以提供一个“速记”符号
`` b_subtilis`，它将自动扩展到“b_subtilis_1423”，因为
它出现在内置表中（自行承担风险！）
贡献
——
本项目由Zulko在爱丁堡基因组铸造厂启动，并在“Github<；https://github.com/edinburgh genome foundry/codon usage tables>；”上发布，获得公共域许可证（不提供任何保证，如果不确定，请与其他来源交叉检查密码子使用情况）。如果您想到更常用的物种，请随意添加其他表格。
安装
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通过PIP：
……代码：：bash
pip安装python_codon_tables
手册：
…代码：：bash
（sudo）python setup.py install
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