用于超级增强器排序的python包
pyrose的Python项目详细描述
pyrose是一个易于安装和运行的python库rose(超级增强器的等级排序) http://younglab.wi.mit.edu/super_enhancer_code.html
如果您使用此库进行分析,请引用以下论文:
- Warren A.Whyte,David A.Orlando,Denes Hnisz,Brian J.Abraham,Charles Y.Lin,Michael H.Kagey,Peter B.Rahl,Tong Ihn Lee和Richard A.Young,转录因子和介导因子大师在关键细胞识别基因上建立超级增强子,细胞153,307-319,2013年4月11日
- Jakob Lovén,Heather A.Hoke,Charles Y.Lin,Ashley Lau,David A.Orlando,Christopher R.Vakoc,James E.Bradner,Tong Ihn Lee,and Richard A.Young,通过破坏超级增强子选择性抑制肿瘤癌基因,细胞153,320-334,2013年4月11日
如何安装?
从pypi安装
pip install pyrose
从源安装
python setup.py install
怎么跑?
pyrose –help