pyobjcryst 2.1.0.post2

要求

sudo apt-get install \
   python-setuptools python-numpy scons \
   build-essential python-dev libboost-all-dev

安装

首选方法是使用anaconda python并从 水蟒包装的“diffpy”通道

conda config --add channels diffpy
conda install pyobjcryst

pyobjcryst也包含在“diffpy cmi”集合中 用于结构分析的包数

conda install diffpy-cmi

如果您希望使用其他python发行版或从源代码安装， 必须首先按照中的说明安装libobjcryst库 https://github.com/diffpy/libobjcryst。确保其他要求 软件也已就位，然后运行：

python setup.py install

您可能需要将sudo与系统python一起使用，因此该过程是 允许将文件复制到系统目录。if管理员（根） 访问不可用，请参阅 python setup.py install --help用于安装到的选项 用户可写的位置。安装完整性可以是 通过使用

python -m pyobjcryst.tests.run

安装pyobjcryst的另一种方法是使用scons工具， 它可以通过编译C++文件在几个过程中加快进程 并行作业（-J4）：

scons -j4 install

有关生成目标和选项的说明，请参见scons -h。

发展

pyobjcryst是作为 布鲁克海文国家学院的Diffpy CMI复杂建模计划 实验室。pyobjcryst源托管在 https://github.com/diffpy/pyobjcryst。

你可以自由地为这个项目做贡献。安装pyobjcryst 在开发模式中，其源代码由python直接使用 使用

python setup.py develop --user

开发时最好编译C++文件 scons使用build=develop选项，该选项编译扩展名 带有调试信息和C断言检查的模块

scons -j4 build=debug develop

生成脚本检查是否存在sconsvars.py文件，该文件 可用于永久设置build变量。烤饼 构造环境可以在^{tt13}中进一步定制$ 脚本。可以通过执行单元测试来验证包的完整性 scons -j4 test。

在使用anaconda python开发时，必须指定 活动的头路径、库路径和运行时库路径 水蟒环境。这可以通过设置CPATH来实现， LIBRARY_PATH和LDFLAGS环境变量如下：

# resolve the prefix directory P of the active Anaconda environment
P="$(conda info --json | grep default_prefix | cut -d\" -f4)"
export CPATH=$P/include
export LIBRARY_PATH=$P/lib
export LDFLAGS=-Wl,-rpath,$P/lib
# compile and re-install pyobjcryst
scons -j4 build=debug develop

注意，所需libobjcryst库的anaconda包已经构建 用Python提供的C++编译器。这可能会导致不兼容 用系统C++。在这种情况下，请使用AcANDA DA C++来构建PyObjistST。

联系人

有关pyobjcryst的详细信息，请访问项目网页

http://www.diffpy.org

或者给simon billinge教授发邮件到sb2896@columbia.edu。