python的医学术语:snomed ct、icd10、meddra、cdf、umls和vcm图标
PyMedTermino的Python项目详细描述
pymedttermino(python的医学术语)是一个python模块,用于 很容易使用python中的主要医学术语。 支持以下术语:snomed ct、icd10、meddra、cdf、umls和vcm 图标(巴黎13大学开发的图标术语)。 PymedTermino有助于访问术语,但不包括术语 目录(VCM除外);术语目录应单独获取 (例如从umls下载)。
Pymedtermino是在Limics研究实验室创建的, 巴黎13大学,巴黎索邦城,欧洲工商管理学院,1142年,巴黎6大学 让·巴普蒂斯特·拉米。Pymedtermino在GNU LGPL许可证下可用,并且 在下面的科学文章中描述(如果您使用Pymedtermino,请引用它!):
拉米·巴蒂斯特,维诺特·A,杜克洛斯·C。 PyMedTermino: an open-source generic API for advanced terminology services. 螺柱健康技术通告2015;210:924-928
如有问题,请联系jean-baptiste lamy<;jean-baptiste.lamy@univ-paris13。fr>;
LIMICS University Paris 13, Sorbonne Paris Cité Bureau 149 74 rue Marcel Cachin 93017 BOBIGNY FRANCE
我能用皮美德特米诺做什么?
>>> ICD10.search("tachycardia") [ ICD10[u"I49.5"] # Sick sinus syndrome , ICD10[u"I47.2"] # Ventricular tachycardia , ICD10[u"F43.0"] # Acute stress reaction , ICD10[u"I47"] # Paroxysmal tachycardia , ICD10[u"I47.1"] # Supraventricular tachycardia , ICD10[u"I47.9"] # Paroxysmal tachycardia, unspecified , ICD10[u"R00.0"] # Tachycardia, unspecified , ICD10[u"O68.0"] # Labour and delivery complicated by fetal heart rate anomaly ] >>> ICD10[u"I47"].parents [ICD10[u"I30-I52"] # Other forms of heart disease ] >>> ICD10[u"I47"].children [ ICD10[u"I47.0"] # Re-entry ventricular arrhythmia , ICD10[u"I47.2"] # Ventricular tachycardia , ICD10[u"I47.1"] # Supraventricular tachycardia , ICD10[u"I47.9"] # Paroxysmal tachycardia, unspecified ] >>> list(ICD10[u"I47"].ancestors_no_double()) [ ICD10[u"I30-I52"] # Other forms of heart disease , ICD10[u"IX"] # Diseases of the circulatory system ] >>> ICD10[u"I47"] >> VCM # Maps the ICD10 concept to VCM icon Concepts([ VCM[u"current--hyper--heart_rhythm"] # tachycardia ])
pymedtermino也可以在不使用python的情况下使用,只用于将术语内容转换为sqlite3数据库。
链接
bitbucket上的pymedttermino(开发存储库):https://bitbucket.org/jibalamy/pymedtermino
pypi上的pymedtermino(python包索引,稳定版本):https://pypi.python.org/pypi/PyMedTermino