一个用于点阵光片图像分析的python库
pylattice的Python项目详细描述
Pylattice
用于高级晶格光片图像分析的python库
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安装
克隆或下载存储库
pip install pylattice
pip install -r requirements.txt
cd source/jupyter
jupyter notebook
在浏览器中打开source/jupyter/latticeFrame_showFrame.ipynb
测试数据
一个小的测试数据集可以在这里找到： https://www.dropbox.com/sh/s7q45h7wqoco5hl/AAB2Tt5lTGSkF2VhMTMM8NEWa?dl=0
常见问题解答
Lattice Light-Sheet Microscopy
参考文献
- 科学工具包http://scikit-image.org
- 嵌合体https://www.cgl.ucsf.edu/chimerax/
- llsm工具https://github.com/francois-a/llsmtools
- utrackhttps://www.utsouthwestern.edu/labs/danuser/software/#utrack_ancs
- 约翰舍内贝格http://www.schoeneberglab.org
- betzig实验室https://www.janelia.org/lab/betzig-lab
- 德鲁宾/巴恩斯实验室https://drubinbarneslab.berkeley.edu
欢迎加入QQ群-->： 979659372
