用于免疫金诊断的开放源码批量金粒子采集与处理
pygempick的Python项目详细描述
PyGemPick有三个主要依赖项,在使用前需要它们
1. [OpenCV (cv2)](https://opencv.org/) 2. [Pandas (pd)](https://pandas.pydata.org/) 3. [Numpy (np)](http://www.numpy.org/)
我建议安装一个新的水蟒环境 蟒蛇 您可以将所有必需的模块导入到 项目。安装opencv时遇到问题,请使用下面列出的解决方案 这里: (使用 康达) Pandas和Numpy也可以通过任何终端使用 *PIP进行安装 安装pandas,numpy*
该项目将在接下来的几周内更新,并提供有关如何 使用 pygempick 。这个模块是 旨在帮助研究人员构建治疗方案 (基于治疗和诊断的创新)帮助患者 罕见的蛋白质错误折叠疾病,如attr淀粉样变性,阿尔茨海默氏症 疾病 (AD) 额颞叶痴呆 (ftd)和 肌萎缩性侧索硬化症(也称为als或lou-gehrig's 疾病)使用新奇 免疫金诊断技术。
*新增:* 此更新包含补充11个补充文档 这将帮助您使用模块。我们讨论图像压缩,图像 利用奇异和重复滤波进行挑选,统计分析, 分离和效率测试,测试算法的可用性。
将提供样本图像数据,并应位于数据中 文件夹
安装
pip install pygempick > import pygempick.core as py > import pygempick.modeling as mod > import pygempick.spatialstats as spa