pybool:一个用来推断布尔网络的包。
pybool的Python项目详细描述
pybool:一个python包,在给定一组约束的情况下推断布尔网络。
想想一个生物学家在研究一个特殊的 监管网络。他们研究了一组已知在 网络。他们对特定的监管关系有一定的背景知识 从他自己的研究或文学中。除此之外,他们还有 显示基因表达时间顺序的扰动数据 一些条件。例如,这些可以从函数损失中导出 或者过度表达实验。生物学家想阐明 网络为此可以进行各种实验来测试特定的调节 连接。这些实验既费钱又费时。哪个 他们应该关注关系吗?这就是Pybool包可以提供帮助的地方。 通过使用布尔逻辑对候选监管网络建模,pybool评估 哪些网络与扰动数据和已知的 监管关系。