空间运动分析程序
pupil-analysis的Python项目详细描述
伪瞳孔分析套件
专门用于瞳孔Imsoft数据的空间运动分析软件。通常，可用于遵循层次结构的数据
data_directory
├── specimen_01
│ ├── experiment_01
│ │ ├── image_001.tif
│ │ └── image_002.tif
│ └── ...
└── ...
安装
目前有两种支撑安装方式。 在Windows上，除非您熟悉Python，否则独立安装程序可能是最佳选择。 在其他平台上，使用pip。在
Windows上的安装程序（最简单）
一个Windows安装程序，将pseudo-purpeat分析套件及其所有依赖项捆绑在一起， 包含完整的Python运行时，请访问 Releases。在
安装程序创建了一个名为瞳孔分析的开始菜单shorcut， 可用于启动GUI。在
要卸载，请使用Windows中的添加或删除程序功能。在
使用pip（python标准方式）
可以使用命令安装来自PyPi的最新版本
^{pr2}$这应该安装所有必需的依赖项，除非在Windows上，OpenCV可能需要 Visual C++ Runtime 2015待安装。在
然后，将现有安装升级到最新版本
pip install --upgrade pupil-analysis
在回归的情况下，可以安装特定版本的套件（例如0.1.2）
pip install pupil-analysis==0.1.2
最后，从Python打开GUI
importpupilanalysis.tkguiasguigui.run()
或从命令行
python -m pupilanalysis.tkgui
如何使用
首先，打开数据目录。接下来，选择感兴趣的区域（roi），然后运行度量移动。 ROI和运动保存在磁盘（C:\Users\USER\PupilAnalysis或/home/USER/.PupilAnalysis），因此每个样本只需要执行一次这些步骤。在
在最初的步骤之后，您可以在程序或 通过复制粘贴到您喜欢的电子表格或打印程序导出数据。在
注释
这仍然是一个早期的开发版本（除了粗糙的边缘）。- 项目
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