用于量化和注释mirna表达的应用程序。
prost的Python项目详细描述
micrornas(mirnas)是一类重要的小的非编码rna(~22nt),具有 在许多发展和疾病中的多重和广泛的调节作用 过程。我们创造了工具普罗斯特!探讨富含mirna的后生动物 RNA序列数据。普罗斯特!量化和规范化表达式级别(以 在多个视图中 差分表达软件如deseq2。普罗斯特的一些关键特征! 包括候选镜像mirnas和假设的5/3 成熟的mirna臂转换。特别值得关注的是 多种调控方式对mirnas转录后修饰的研究 在它们的生物形成过程中。这些修改被认为是很重要的 对参数加载、目标选择和 米尔纳更替。普罗斯特!提供跨样本的有价值量化 几种mirna修饰,例如假定的种子转移, 种子编辑和3核苷酸添加。