植物表型的图像处理包。
plantcv的Python项目详细描述
plantcv:使用计算机视觉进行植物表型分析
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plantcv简介
plantcv[1]是一个用于植物生物学研究的图像处理和特征提取软件包。 它建立在开源软件平台OpenCV[2],NumPy[3]上, 以及MatPlotLib[4]
如果您使用plantcv,请引用我们[1]。
可以找到安装说明here
有关plantcv函数和使用的更多文档,请参见 PlantCV Read the Docs site我们添加了 interactive documentation。
测试图像集可以在我们的Data page上找到。 我们建议首先从丹福思中心进行测试。
我们建议阅读参考文献[1],这是第一份详细介绍plantcv并提供功能示例的出版物。
要投稿,请参见contribution guide
引文:
Fahlgren N、Feldman M、Gehan Ma、Wilson MS、Shyu C、Bryant DW、Hill St、McEntee CJ、Warnasoriya SN、Kumar I, Ficor T,Turnipseed S,Gilbert KB,Brutnell TP,Carrington JC,Mockler TC,Baxter I.(2015)多功能表型 系统和分析平台揭示了setaria中对水资源可用性的不同时间响应。分子植物8: 1520-1535年。http://doi.org/10.1016/j.molp.2015.06.005
bradski g(2000)opencv库。多布博士期刊25(11):120-126. http://www.drdobbs.com/open-source/the-opencv-library/184404319
奥列芬特(2007)科学计算Python。科学与工程计算9:10-20. http://doi.org/10.1109/MCSE.2007.58
Hunter JD(2007)MatplotLib:二维图形环境。科学与工程计算9:90-95。 http://doi.org/10.1109/MCSE.2007.55
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