免疫肽数据集与氨基酸性质
pepdata的Python项目详细描述
以前是各种肽数据集的存储库，现在只包含 Immune Epitope Database和各种 氨基酸性质矩阵。这个包裹可能最终 拆分并将iedb部分放入名为pyiedb的文件中。
氨基酸特性
amino_acid模块包含各种物理/化学 单氨基酸残基的性质及其对间的相互作用 残余物。
单残留特征表被解析成StringTransformer 对象，可以将其视为字典或将字符串矢量化。 当你调用他们的方法transform_string时。
单残留特征的示例：-hydropathy-volume- polarity-pK_side_chain-prct_exposed_residues- ^{TT10}$-^{TT11}$-^{TT12}$- local_flexibility-accessible_surface_area_folded- alpha_helix_score（周法曼）-beta_sheet_score（周法曼） -turn_score（周法曼）
成对的交互表被解析为嵌套的字典，以便 氨基酸x和y之间的相互作用可以确定 来自d[x][y]。
成对交互字典：-strand_vs_coil（及其 转置coil_vs_strand）-helix_vs_strand（及其转置 strand_vs_helix）-helix_vs_coil（及其转置 coil_vs_helix）-blosum30-blosum50-blosum62
还有一个函数可以解析PMBEC similarity matrix的系数， 尽管它目前位于单独的pmbec模块中。
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