面向对象的蛋白质数据库文件处理
pdb-objects的Python项目详细描述
PDB对象
一组面向对象处理pdb文件记录的类
?2019乔治·D·沃森,约克大学 (https://georgewatson.me)
有麻省理工学院的执照。请参阅许可证文件。
此软件包在 a post on my blog。
支持以下记录类型:
ATOM
HETATM
TER
HELIX
SHEET
当前未实现其他记录类型,但可以在 请求。
公开以下类:
PDBRecord
(通常不应直接使用,除非用于实现 另一种记录类型)Residue
Coords
Atom
(用于atom和hettm记录)Helix
Sheet
Ter
公开以下公共功能:
read_atom
read_helix
read_sheet
read_ter
read_record
read_pdb
有关详细信息,请参见类、函数和方法docstrings。
安装
可用on PyPI。
使用pip3 install pdb-objects
安装,
然后将import pdb_objects
放在脚本的顶部。
或者,克隆 this repository。