用于处理NexSON格式的系统发生树的库
nexson的Python项目详细描述
nexson是一个用于处理 Open Tree of Life project存储有关外部产生的系统磁树的信息。 包是从peyotl重构的,这是一个更通用的包。
说明书
python3 -mvenv env source env/bin/activate pip install -r requirements.txt python setup.py develop python setup.py test
执行基本安装和测试。
谢谢
感谢NSF和{a3}的资金支持。
《nexson》主要由Mark Holder、Emily Jane McTavish和Jim Allman撰写, 但是请参阅CONTRIBUTORS文件以获得更完整的列表 提供代码的人。
吉姆·奥尔曼、凯伦·克兰斯顿、科迪·辛奇利夫、马克·霍尔德、彼得·米德福德和乔纳森·里斯 所有人都参加了导致NexSON地图绘制的讨论。
- peyotl/test/data/nexson/phenoscape/nexml测试文件来自
- https://raw.github.com/phenoscape/phenoscape-data/master/Curation%20Files/completed-phenex-files/Characiformes/Buckup_1998.xml Phenoscape文件(下载),NESCent[2014年2月16日]数据的引用在nexml文档中。
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