应用于神经科学文献的治疗。
neurocurator的Python项目详细描述
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用于注释查看器或与 请参阅OpenMinTeD平台 到 这branch。
神经馆长
桌面应用程序执行系统化和协作性管理 神经科学文献。
这是python模块的图形用户界面(gui) NeuroAnnotation Toolbox (NAT)。
下面将详细描述此框架 打开存取纸:https://doi.org/10.3389/fninf.2017.00027。
对于神经馆长,注释是:-可跟踪的,-可跨 项目,—由受控词汇构成
开始
安装
在安装了git和imagemagick 6之后:
pip3 install neurocurator
如果您想使用miniconda简化安装:
conda create --name nc python=3.7 conda activate nc conda install beautifulsoup4 gitpython lxml numpy pandas scipy pip install neurocurator
要求
启动
neurocurator
如果您使用过miniconda:
conda activate nc neurocurator
升级
pip install --upgrade neurocurator
如果您使用过miniconda:
conda activate nc pip install --upgrade neurocurator
释放
版本及其显著变化列在releases section中。
路线图
正在进行中
- 使注释可以发布到一个Blue Brain Nexus实例中。
- 稳定神经馆长和nat(软件架构)。
todo
- 完全集成Annotation Viewer 变成神经馆长。
- 半自动化的知识提取过程。
完成(最新开始)
- 删除神经馆长(Qt 4和Python 3.4)中的遗留依赖项
- 将开放式注释集成到文献管理中 框架。
- 可视化神经馆长和开放注释直接在PDF上。
- 使神经馆长易于安装,尤其是科学家。
于2018年7月20日更新。
状态
创建于2016年。
分行持续稳定和重组 重构架构
分支refactor architecture是not用于 最终用户。
新功能、错误修复和改进是在重新设计的 代码部分。
当重新设计的代码段是稳定的时,它就合并到分支中 master发布了一个版本。