应用于神经科学文献的治疗。

neurocurator的Python项目详细描述


Getting Started| Upgrade| ReleasesRoadmap| Status

用于注释查看器或与 请参阅OpenMinTeD平台 到 这branch

神经馆长

桌面应用程序执行系统化和协作性管理 神经科学文献。

这是python模块的图形用户界面(gui) NeuroAnnotation Toolbox (NAT)

下面将详细描述此框架 打开存取纸:https://doi.org/10.3389/fninf.2017.00027

对于神经馆长,注释是:-可跟踪的,-可跨 项目,—由受控词汇构成


开始

安装

在安装了git和imagemagick 6之后:

pip3 install neurocurator

如果您想使用miniconda简化安装:

conda create --name nc python=3.7
conda activate nc
conda install beautifulsoup4 gitpython lxml numpy pandas scipy
pip install neurocurator

要求

启动

neurocurator

如果您使用过miniconda:

conda activate nc
neurocurator

升级

pip install --upgrade neurocurator

如果您使用过miniconda:

conda activate nc
pip install --upgrade neurocurator

释放

版本及其显著变化列在releases section中。

路线图

正在进行中

  1. 使注释可以发布到一个Blue Brain Nexus实例中。
  2. 稳定神经馆长和nat(软件架构)。

todo

  1. 完全集成Annotation Viewer 变成神经馆长。
  2. 半自动化的知识提取过程。

完成(最新开始)

  • 删除神经馆长(Qt 4和Python 3.4)中的遗留依赖项
  • 将开放式注释集成到文献管理中 框架。
  • 可视化神经馆长和开放注释直接在PDF上。
  • 使神经馆长易于安装,尤其是科学家。

于2018年7月20日更新。

状态

创建于2016年。

分行持续稳定和重组 重构架构

分支refactor architecturenot用于 最终用户。

新功能、错误修复和改进是在重新设计的 代码部分。

当重新设计的代码段是稳定的时,它就合并到分支中 master发布了一个版本。

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
Java:字符串。RTL设备语言用标志“+”格式化,数字后加符号   java GAE作为桌面应用程序(Swing)的服务提供商   java将InputStream转换为FileInputStream不适用于Apache POI   java外部Voronoi库“网格”:什么是草图和处理?   重载重写的泛型方法java   java显示组织上设置的错误。springframework。验证。jsp中的错误对象   java一些Spring模型属性没有显示在我的JSP中   java无法编译Guava 23的SimpleTimeLimiter示例   java如何更改JTree中的“根”目录名?   java如何在安卓中对相对布局产生连锁反应?   java错误:org。冬眠例外SQLGrammarException:无法提取结果集,dateAccessed是未知列   如何使用java监听JSON文件更新   由抽象封闭类创建的匿名内部类能否通过反射确定实现类?