可重复使用和可配置的nipype神经成像管道。
neuro-pypes的Python项目详细描述
#神经性脓疱
[！[生成状态]（https://travis-ci.org/Neurita/pypes.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/Neurita/pypes） [！[阅读文档]（https://readthedocs.org/projects/neuro-pypes/badge/?version=latest)](http://neuro-pypes.readthedocs.io） [！[doi]（https://zenodo.org/badge/46623736.svg)](https://zenodo.org/badge/latestdoi/46623736）
使用[nipype]（http://nipype.readthedocs.io/）和最新技术的可重复使用的神经成像管道 神经影像预处理软件。
本项目的目标是：
- 易于使用、完整、可重复使用和可配置的预处理管道，以及
- 高质量的结果与最少的人工干预的图像。
##文档
请看一下文档[这里]（http://neuro-pypes.readthedocs.io）。
##引文
如果您使用pypes，请引用：
` Alexandre M. Savio, Michael Schutte, Manuel Graña and Igor Yakushev Pypes: Workflows for Processing Multimodal Neuroimaging Data Front. Neuroinform., April 2017, vol 11, 2017, pages 25 issn: 1662-5196 doi: 10.3389/finf.2017.00025 ` [https://doi.org/10.3389/fninf.2017.00025](https://doi.org/10.3389/fninf.2017.00025）
…或bibtex： ` @ARTICLE{10.3389/fninf.2017.00025, AUTHOR={Savio, Alexandre M. and Schutte, Michael and Graña, Manuel and Yakushev, Igor}, TITLE={Pypes: Workflows for Processing Multimodal Neuroimaging Data}, JOURNAL={Frontiers in Neuroinformatics}, VOLUME={11},PAGES={25},YEAR={2017},URL={http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fninf.2017.00025},DOI={10.3389/fninf.2017.00025},ISSN={1662-5196} } ` 还可以考虑引用[nipype]（http://nipype.readthedocs.io）和您使用的所有其他开源工具。
##许可证
在2.0版apache许可下授权。
更改日志
版本1.1.2（16.04.2018）
###功能：
- 将--extra参数添加到nitap motion以获取额外的主题元数据。
- 将nipype版本提升到1.0.2。几乎没有修复。
版本1.1.1（2018年3月8日）
###错误修复：
- 修复cli/cli.py文件中的错误导入。
- 修复nitap plot命令中的错误。
版本1.1.0（2018年3月1日）
###功能：
- 添加带有plot和motion子命令的nitapcli。
###文档：
- 为命令行界面添加了一个新部分。
###代码更改：
- 已将所有导入路径更改为绝对路径。
- 线宽改为120。
- 许多代码样式的更改都是为了实现自动的lint检查。
版本1.0.1
- 错误修复：一些错误的导入名称与模块名称更改。
- 错误修复：添加了缺少的需求。
版本1.0.0
- api break：将模块名从pypes更改为neuro_pypes。
- 文件更新。
版本0.3.5
- 修复fmri管道atlas输出中的连接命名。
版本0.3.4
- 修复fmri管道atlas输出中的连接命名。
版本0.3.3
- 修复SPM+直接管道中的输出重命名。
- 向多切片绘图函数添加black_bg参数。
- 将运动统计表添加到fmri实用程序中。
- 对从新nipype引发错误的导入顺序的一般修复。
版本0.3.2
- 将atlas扭曲添加到fmri管道。
- 修复功能磁共振管道。
版本0.3-0.3.1
- 在DTI管道中添加运动统计度量。
- 改进文档。
- 将spm+direct选项添加到解剖预处理。
- 在tasks.py中添加invoke示例。
- 样式和错误修复。
- 修复最新nipype版本的导入。
- 将plot_ortho_slices函数添加到nilearn接口。
版本0.2.0-0.2.1
- 添加mkdocs文档并阅读docs设置。
- 添加宠物和功能磁共振成像的注册选项。在配置中为此添加选项。
- 为fmri和pet管道添加组模板。
- 将脑罩输出添加到解剖mr管道。
- 重命名/重新构造fmri管道和文件。
- 改进宠物输出文件命名。
- 在配置中为camino添加设置。
- 修复切片时间参数中的“获取切片”错误。
- 错误修复。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
](https://travis-ci.org/Neurita/pypes){kind=link}
](https://zenodo.org/badge/latestdoi/46623736){kind=link}