一种转换器，它接受一个网络（cnet，igraph，networkx，pathpy，…）并创建一个tikz网络以平滑地集成到乳胶中。

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network2tikz的Python项目详细描述


网络2tikz

<表><广告>模块：网络2tikz< /广告><正文>日期：2018年11月7日作者：于尔根·哈克尔联系方式：hackl.j@gmx.at许可证：GNU GPLv3版本：0.1.8

这是用于转换网络的python工具network2tikz 可视化到tikz中 （tikz网络） 数字，用于本地包含到乳胶文档中。

network2tikz与python 3一起工作，并且（当前）支持 以下是python网络模块：

network2tikz的输出是 在tikz网络中 位于tikz上的库， 它允许可视化和修改 具体需求和出版物。

因为你不仅得到了网络的图像，而且 在乳胶源文件中，您可以轻松地对图形进行后期处理 （例如，添加图纸、文本、方程式等）。

因为一幅画胜过千言万语，所以举个小例子：

nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)

（见上文）给出

\documentclass{standalone}\usepackage{tikz-network}\begin{document}\begin{tikzpicture}\clip (0,0) rectangle (6,6);
\Vertex[x=0.785,y=2.375,color=red,opacity=0.5,label=Alice]{a}\Vertex[x=5.215,y=5.650,color=blue,opacity=0.5,label=Bob]{b}\Vertex[x=3.819,y=0.350,color=red,opacity=0.5,label=Claire]{c}\Vertex[x=4.654,y=2.051,color=blue,opacity=0.5,label=Dennis]{d}\Edge[,bend=-8.531](a)(c)
\Edge[,bend=-8.531](c)(d)
\Edge[,bend=-8.531](d)(b)
\Edge[,bend=-8.531](a)(b)
\end{tikzpicture}\end{document}

看起来像

example

调整情节很简单，可以作为 乳胶工作流。 tikz网络手册 包含多个如何使情节看起来更好的示例。

安装

network2tikz可以从python包索引中获得，因此只需键入

pip install -U network2tikz

安装/更新。

用法

  1. 生成、操纵和研究结构、动力学和 你的复杂网络的功能和往常一样 python模块。

  2. 而不是默认的绘图函数（例如igraph.plot（）或 networkx.draw（））调用network2tikzby 

    plot(G,'mytikz.tex')

    将网络可视化存储为tikz文件 mytikz.tex。使用以下命令加载模块：

    fromnetwork2tikzimportplot

    高级用法： 当然，你总是可以通过操纵 生成的乳胶文件，但为什么不直接在python中执行呢？做 所以，所有可视化选项都可用 在tikz网络中也有 在network2tikz中实现。情节的出现可以是 按关键字参数修改（有关详细说明，请 见下文）。

    my_style={}plot(G,'mytikz.tex',**my_style)

    参数遵循中可用的选项 tikz网络库 并在 这个 tikz网络手册

    另外，如果您对最终输出更感兴趣， 不仅使用了.tex文件 

    plot(G,'mypdf.pdf')

    将绘图保存为PDF格式，或

    plot(G)

    创建时间图直接显示结果， 也就是说，类似于matplotlib函数show（）。最后，你可以 同时创建一个节点和边列表，它可以被读取并且很容易 修改（在后处理步骤中） 使用tikz网络 

    plot(G,'mycsv.csv')

  3. 注意：

    < Buff行情>

    为了编辑这个情节，请确保 安装了tikz网络！

  4. 编译图或将mytikz.tex的内容添加到 乳胶源代码。使用选项standalone=false仅使用tikz 图将被保存，然后可以很容易地包含在 乳胶文档通过\input{/path/to/mytikz.tex}

    5. < > >

    简单示例

    为了便于说明，类似于 这个 python-igraph教程 使用。如果您正在使用另一个python网络模块，并且喜欢 按照这个例子，请看一下 这个 提供的示例

    创建网络对象并添加一些边。

    nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)
    0

    添加节点和边缘属性。

    nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)
    1

    现在已经可以绘制网络。

    nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)
    2 examplenodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)3

    这将打开一个显示 网络的表示，如下所示 图：

    examplenodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)4 example

    注意：

    < Buff行情>

    而不是命令margins命令margin可以 使用。也可以使用 使用。有关详细信息，请参见下表。

    在中保留网络的可视表示的属性 与网络本身分离。您可以简单地设置一个python 包含要传递到绘图的关键字参数的字典 然后使用双星号（**）运算符传递 将属性设置为绘图的样式：

    nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)
    5

    节点选项

    nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)
    6

    边缘选项

    nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)
    7

    常规选项和绘图命令。

    nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)
    8 example

    除了显示网络，我们还可以生成乳胶源 文件，以后可以使用和修改。这是通过添加 以'.tex'

    结尾的输出文件名 
    nodes=['a','b','c','d']edges=[('a','b'),('a','c'),('c','d'),('d','b')]gender=['f','m','f','m']colors={'m':'blue','f':'red'}style={}style['node_label']=['Alice','Bob','Claire','Dennis']style['node_color']=[colors[g]forgingender]style['node_opacity']=.5style['edge_curved']=.1fromnetwork2tikzimportplotplot((nodes,edges),'network.tex',**style)
    9 
    \documentclass{standalone}\usepackage{tikz-network}\begin{document}\begin{tikzpicture}\clip (0,0) rectangle (6,6);
\Vertex[x=0.785,y=2.375,color=red,opacity=0.5,label=Alice]{a}\Vertex[x=5.215,y=5.650,color=blue,opacity=0.5,label=Bob]{b}\Vertex[x=3.819,y=0.350,color=red,opacity=0.5,label=Claire]{c}\Vertex[x=4.654,y=2.051,color=blue,opacity=0.5,label=Dennis]{d}\Edge[,bend=-8.531](a)(c)
\Edge[,bend=-8.531](c)(d)
\Edge[,bend=-8.531](d)(b)
\Edge[,bend=-8.531](a)(b)
\end{tikzpicture}\end{document}
    0

    可以生成节点和边列表，而不是tex文件 也可以与TIKZ网络库一起使用。

    \documentclass{standalone}\usepackage{tikz-network}\begin{document}\begin{tikzpicture}\clip (0,0) rectangle (6,6);
\Vertex[x=0.785,y=2.375,color=red,opacity=0.5,label=Alice]{a}\Vertex[x=5.215,y=5.650,color=blue,opacity=0.5,label=Bob]{b}\Vertex[x=3.819,y=0.350,color=red,opacity=0.5,label=Claire]{c}\Vertex[x=4.654,y=2.051,color=blue,opacity=0.5,label=Dennis]{d}\Edge[,bend=-8.531](a)(c)
\Edge[,bend=-8.531](c)(d)
\Edge[,bend=-8.531](d)(b)
\Edge[,bend=-8.531](a)(b)
\end{tikzpicture}\end{document}
    1

    节点列表network_nodes.csv

    \documentclass{standalone}\usepackage{tikz-network}\begin{document}\begin{tikzpicture}\clip (0,0) rectangle (6,6);
\Vertex[x=0.785,y=2.375,color=red,opacity=0.5,label=Alice]{a}\Vertex[x=5.215,y=5.650,color=blue,opacity=0.5,label=Bob]{b}\Vertex[x=3.819,y=0.350,color=red,opacity=0.5,label=Claire]{c}\Vertex[x=4.654,y=2.051,color=blue,opacity=0.5,label=Dennis]{d}\Edge[,bend=-8.531](a)(c)
\Edge[,bend=-8.531](c)(d)
\Edge[,bend=-8.531](d)(b)
\Edge[,bend=-8.531](a)(b)
\end{tikzpicture}\end{document}
    2

    edge列表network\u edges.csv

    \documentclass{standalone}\usepackage{tikz-network}\begin{document}\begin{tikzpicture}\clip (0,0) rectangle (6,6);
\Vertex[x=0.785,y=2.375,color=red,opacity=0.5,label=Alice]{a}\Vertex[x=5.215,y=5.650,color=blue,opacity=0.5,label=Bob]{b}\Vertex[x=3.819,y=0.350,color=red,opacity=0.5,label=Claire]{c}\Vertex[x=4.654,y=2.051,color=blue,opacity=0.5,label=Dennis]{d}\Edge[,bend=-8.531](a)(c)
\Edge[,bend=-8.531](c)(d)
\Edge[,bend=-8.531](d)(b)
\Edge[,bend=-8.531](a)(b)
\end{tikzpicture}\end{document}
    3

    plot函数的详细信息

    \documentclass{standalone}\usepackage{tikz-network}\begin{document}\begin{tikzpicture}\clip (0,0) rectangle (6,6);
\Vertex[x=0.785,y=2.375,color=red,opacity=0.5,label=Alice]{a}\Vertex[x=5.215,y=5.650,color=blue,opacity=0.5,label=Bob]{b}\Vertex[x=3.819,y=0.350,color=red,opacity=0.5,label=Claire]{c}\Vertex[x=4.654,y=2.051,color=blue,opacity=0.5,label=Dennis]{d}\Edge[,bend=-8.531](a)(c)
\Edge[,bend=-8.531](c)(d)
\Edge[,bend=-8.531](d)(b)
\Edge[,bend=-8.531](a)(b)
\end{tikzpicture}\end{document}
    4

    参数

    • 网络：网络对象

      要绘制的网络。网络可以是"cnet"、"networkx"、"igraph"， "pathpy"对象，或节点列表和边列表的元组。

    • 文件名：文件、字符串或无，可选（默认为无）

      要保存的文件或文件名。文件结尾指定 输出。即文件以".tex"结尾 已创建；如果文件以.pdf结尾，则创建pdf；如果文件 以".csv"结尾，生成两个csv文件（filename_nodes.csv 和filename_edges.csv）。如果文件名是字符串的元组，则 第一个条目将用于命名节点列表和第二个条目 对于边列表；如果未定义结束和类型， 已编译并显示临时PDF文件。

    • 键入：str或none，可选（默认为none）

      输出文件的类型。如果没有通过文件名定义结尾， 输出文件的类型可以由 选择权。目前支持以下输出类型： "tex"、"pdf"、"csv"和"dat"。

    • kwds：关键字参数，可选（默认值=无属性）

      用于修改绘图外观的属性。 有关详细信息，请参见下文。

    节点样式的关键字参数

    • 节点大小：节点的大小。默认值为0.6厘米。

    • 节点颜色：节点的颜色。默认为浅蓝色。颜色可以 由通用颜色名或3元组浮点指定 （R、G和B部件的范围为0到255）。

    • 节点不透明度：节点的不透明度。默认值为1。的范围 数字介于0和1之间。其中0表示完全透明的填充 和1 A固体填充。

    • 节点标签：在节点旁边绘制的标签。

    • 节点标签位置：默认情况下，标签位置在 节点的中心。经典的tikz命令可用于更改 标签的位置。相反，使用这样的命令，位置可以是 通过输入一个介于-360和360之间的数字来确定角度。这个 原点（0）是Y轴。正数改变位置计数器 顺时针，负数则顺时针改变。

    • 节点标签距离：节点和标签之间的距离。

    • 节点标签颜色：标签颜色。

    • 节点标签大小：标签的字体大小。

    • 节点形状：顶点的形状。可能有： "圆形"、"矩形"、"三角形"和任何其他tikz形状

    • 节点样式：可以通过 选项样式。这些命令中的大多数可以在"tikz和 PGF手册"。包含命令附加选项（例如阴影= ，则该样式的参数必须介于{}方括号之间。

    • 节点层：可以将节点分配给特定层。

    • node_label_off：是抑制所有标签的布尔选项。

    • node_label_as_id：是一个布尔选项，将节点id指定为label。

    • node_math_mode：是一个布尔选项，用于转换实验室埃尔斯成 不使用$$环境的数学表达式。

    • node_pseudo：是创建伪节点的布尔选项，其中 将提供节点名称和节点坐标。

    边缘样式的关键字参数

    • 边宽度：边的宽度。默认单位为点（pt）。

    • 边颜色：边的颜色。默认为灰色。颜色可以 由通用颜色名或3元组浮点指定 （R、G和B部件的范围为0到255）。

    • 边不透明度：边的不透明度。默认值为1。的范围 数字介于0和1之间。其中0表示完全透明的填充 和1 A固体填充。

    • edge_curved：是否应弯曲边。正数 对应于沿逆时针方向弯曲的边，负值 数字对应于沿顺时针方向弯曲的边。零 表示直边。

    • 边缘标签：在边缘旁边绘制的标签。

    • 边缘标签位置：默认情况下，标签位于 线中心的两个节点。经典的tikz命令可用于 更改标签的位置。

    • 边缘标签距离：节点之间的标签位置可以是 使用"距离"选项修改。默认情况下，标签居中 两个节点之间。位置表示为 节点之间的长度，例如距离=0.7，标签放置在 顶点i边缘长度的70%。

    • 边缘标签颜色：标签的颜色。

    • 边缘标签大小：标签的字体大小。

    • edge_style：可以通过 选项样式。这些命令中的大多数可以在"tikz和 PGF手册"。包含命令附加选项（例如阴影= ，则该样式的参数必须介于{}方括号之间。

    • 边箭头大小：边的箭头大小。

    • 边箭头宽度：边上箭头的宽度。

    • 边循环大小：修改边的长度。测量值有 与单元一起插入。默认情况下，环路大小为1厘米。

    • 边环路位置：通过 围绕节点的旋转角度。原点（0）是Y轴。正的 数字逆时针改变回路位置，而负数 数字按顺时针方向更改。

    • edge_loop_shape：自循环的形状由 角度。可以通过减小或增大参数来更改形状 "循环形状"选项的值。

    • edge_directed：是一个布尔选项，它将边转换为directed 箭头。如果网络已定义为定向网络，则此选项 不需要，除非关闭一条或多条边的方向。

    • edge_math_mode是一个布尔选项，它将标签转换为 不使用$$环境的数学表达式。

    • edge_not_in_bg默认情况下，边缘绘制在背景层上 在tikz的照片上。即在边缘之后创建的对象 也出现在上面。若要关闭此选项，请在背景中选择"边不在" 必须启用。

    布局样式的关键字参数

    \documentclass{standalone}\usepackage{tikz-network}\begin{document}\begin{tikzpicture}\clip (0,0) rectangle (6,6);
\Vertex[x=0.785,y=2.375,color=red,opacity=0.5,label=Alice]{a}\Vertex[x=5.215,y=5.650,color=blue,opacity=0.5,label=Bob]{b}\Vertex[x=3.819,y=0.350,color=red,opacity=0.5,label=Claire]{c}\Vertex[x=4.654,y=2.051,color=blue,opacity=0.5,label=Dennis]{d}\Edge[,bend=-8.531](a)(c)
\Edge[,bend=-8.531](c)(d)
\Edge[,bend=-8.531](d)(b)
\Edge[,bend=-8.531](a)(b)
\end{tikzpicture}\end{document}
    5

    • 布局：dict或string，可选（默认值=无） 在二维平面上具有节点位置的字典。这个 dict的键值表示节点id，而 表示坐标的元组（例如n=（x，y））。最初的 布局可以是plac在二维平面上的任意位置编辑。

      可以定义用于布局的算法，而不是字典 通过字符串值。目前，支持的是：

      • 随机布局，其中节点均匀地随机放置在 单位平方。此算法可以使用关键字"random"启用， "随机"、"随机"或"无"

      • Fruchterman-Reingold力定向算法。在这个算法中， 节点由钢圈表示，边缘是弹簧 他们。吸引力类似于弹簧力和 斥力类似于电力。基本思想是 通过移动节点和改变 他们之间的力量。此算法可以使用 关键字："Fruchterman reingold"、"Fruchterman_reingold"、"Fr"， "弹簧布局"，"弹簧布局"，"fr"

    <表><广告>算法 关键字 < /广告><正文>随机随机，随机，随机，无弗鲁赫特曼·雷戈尔德弗鲁克特曼·雷金德，弗鲁克特曼·雷金德，法国弹簧布局，弹簧布局，fr

    • 强制：浮动，可选（默认值=无） 节点间的最佳距离。如果没有，则距离设置为 1/sqrt（n），其中n是节点数。增加此值以移动 节点距离更远。

    • 位置：dict或none可选（默认值为none） 节点作为字典的初始位置，节点作为键和值 作为一个坐标列表或元组。如果没有，则使用随机初始值 位置。

    • 已修复：列表或无，可选（默认为无） 在初始位置保持固定的节点。

    • 迭代：int，可选（默认值=50） 最大迭代次数

    • 阈值：浮动，可选（默认值=1e-4） 节点位置更改中相对错误的阈值。迭代 如果错误低于此阈值，则停止。

    • 权重：字符串或无，可选（默认值=无） 保存用于边的数值的边属性 重量。如果没有，则所有边权重都为1。

    • 维度：int，可选（默认值=2） 布局尺寸。目前，仅支持二维绘图。

    • seed：int或none，可选（默认值为none） 设置确定性节点布局的随机状态。如果是int，seed是 随机数生成器使用的种子，如果没有，则为随机种子 使用由numpy创建的随机数生成器。

    常规选项的关键字参数

    • 单位：字符串或字符串元组，可选（默认值=（'cm'，'pt'）） 默认情况下，所有大小值都基于cm，所有线宽都是 以磅为单位定义。使用此选项，输入单位可以是 改变。当前支持的是：像素"px"，点"pt"， 毫米'mm'，厘米'cm'。如果一个值输入为 所有输入必须用这个单位来定义。如果一个单位元组 在给定的情况下，大小由第一个条目定义 第二个条目。

    • 页边距：none、int、float或dict，可选（默认值为none） 边距定义画布边框的"空"空间。如果没有 边距已定义，边距将根据最大值计算 节点大小，以避免剪切节点。如果单个int或float是 使用此距离定义所有边距。定义不同的边距 所有大小的字典的大小 {'to p'：2，'left'：1，'bottom'：2，'right'：.5}必须使用。

    • 画布：无，int或float元组，可选（默认值=（6,6）） 画布或图形大小定义绘图的大小。输入的值为 一对怒族mber，其中第一个数字是图形的宽度，而 第二个数字是数字的高度。如果选项units不是 所用尺寸以厘米为单位。默认情况下，画布为6cm x 6cm。

    • 保持纵横比：bool，可选（默认值为true） 定义是否保留当前布局的纵横比。如果 false，将重新缩放布局以完全适应 画布中的可用区域（即移除的边距）。如果true，则 保持布局的原始纵横比 在画布中居中。

    • 独立的：bool，可选（默认值为true） 如果此选项为真，将创建一个独立的乳胶文件。即 可以从此输出文件编译图。如果standalone为false， 只有tikz环境存储在tex文件中，并且可以导入 在现有的tex文件中。

    • clean：bool，可选（默认值为true） 编译期间创建的非pdf文件是否应 删除。

    • 清除纹理：bool，可选（默认值为true） 同时删除生成的tex文件。

    • 编译器：str或无，可选（默认值=无） 要使用的乳胶编译器的名称。如果没有，cnet将选择 自己安装一个。从latexmk开始，然后从pdflatex

    • 编译器参数：列表或无，可选（默认值=无） 应传递给乳胶编译器的额外参数。如果这是 无默认为空列表。

    • 无提示：bool，可选（默认值为true） 是否隐藏编译器输出。

    关键字命名约定

    在样式字典中，可以使用多个关键字来寻址 属性。这些关键字将转换为唯一的关键字， 在剩余代码中使用。这允许保留在 igraph

    <表><广告>键 其他有效键 < /广告><正文>节点顶点，v，n边缘链接，l，e利润率利润率画布bbox，数字大小单位单位固定固定节点，固定顶点，固定值，固定值位置初始位置，节点位置顶点位置，n位置，V_位置

    待办事项

    • []添加多层处理程序

    更改日志

    <表><广告>版本 日期 更改 < /广告><正文>0.1.02018年5月21日对github的初始提交0.1.12018年5月22日对pypi的初始提交0.1.22018年5月27日修复了Windows编译问题0.1.32018年7月17日修正了坐标为零时的布局问题0.1.42018年7月29日添加了一些布局算法0.1.52018年7月30日允许将多个网络添加到同一绘图0.1.62018年8月7日一些较小的错误修复程序0.1.72018年11月05日 修复了pathpy和csv导出的错误0.1.82018年11月7日修复了cnet和pathpy依赖关系

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