邻域算法优化与集成评价

neighborhood的Python项目详细描述


特拉维斯ci:image0

python 3“邻域算法”直接搜索的实现 优化与贝叶斯集成评价。简言之,A 基于voronoi多边形的最近邻插值用于 将失配(搜索)和后验概率(评估)插值到 允许对高维问题进行有效的采样和集成。 参考文献中提供了理论和实现的详细信息。

https://raw.githubusercontent.com/keithfma/neighborhood/master/example_rosenbrock_4d.png

4d罗森布鲁克目标函数的搜索总体示例。图像 包含1000次邻域迭代中收集的10000个样本 算法直接搜索,使用num_samp=10num_resamp=5。这个 真正的最小值是0(1, 1, 1, 1),而最好的示例是 0.0113位于((0.976, 0.953, 0.908, 0.824)。这个结果还在继续 收敛到更大的样本量(但是这个图没有那么有趣,因为 密度收敛到一个点!)

要生成上面的示例图,可以运行内部演示, 喜欢这样:

importneighborhoodasnbrnbr.demo_search(ndim=4,nsamp=10,nresamp=5,niter=500)

等效地,您可以执行以下操作:

importneighborhoodasnbrnum_dim=4srch=nbr.Searcher(objective=nbr.rosenbrock,limits=[(-1.5,1.5)for_inrange(num_dim)],num_samp=10,num_resamp=5,maximize=False,verbose=True)srch.update(500)srch.plot()

状态

优化实施,集成评估正在进行中。

测试

此项目使用pytest作为 单元测试。目的不是劝诫,而是提供合理的 保证一切如广告所示。要跑,只要打电话 pytest --verbose来自此包中的某个位置。

释放

发布版本在存储库中标记为发行版, 并上传到pypi。执行此操作的最小命令是:

# update PyPI-readable README
pandoc --from=markdown --to=rst --output=README.rst README.md
# build with setuptools
python3 setup.py sdist bdist_wheel
# upload to PyPI test server (then check it out)
twine upload --repository-url https://test.pypi.org/legacy/ dist/*
# upload to PyPI
twine upload dist/*
# tag release in git repo
git tag -a X.X.X -m "vX.X.X"
git push origin --tags

参考文献

  1. Sambridge,M.(1999年)。近邻地球物理反演 算法一,搜索一个参数空间。地球物理杂志 国际,138(2),479-494. http://doi.org/10.1046/j.1365-246X.1999.00876.x
  2. Sambridge,M.(1999年)。带邻域的地球物理反演 算法-
  1. 评估合奏。Geophys,国际法院,138727-746. http://doi.org/10.1046/j.1365-246x.1999.00900.x

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