ndex python实用程序。包括文件转换和导入功能

ndex-utils-dev的Python项目详细描述


#ndex python实用程序

除了python之外,这些实用程序还需要一些额外的模块。

要安装这些模块,请键入以下命令:

`shell pip install requests pip install requests-toolbelt pip install ndex `

实用程序脚本:

在所有具有参数username和password的脚本中,这些将是您正在使用的ndex帐户的用户名和密码。

上传到ndex.py

`shell python upload-to-ndex.py <username> <password> <directory> `

其中,<;i>;目录<;i>;包含要上载的所有网络文件。

从tsv.py创建网络

`shell python create_network_from_tsv.py <username> <password> <ndex server> <tsv file> <import plan file> <network name> <network description> ` 更改网络描述.py

更改网络版本.py

使网络公开.py

使网络私有化.py

删除所有网络.py

获取用户帐户统计信息.py

下载pc路径.py

`shell download_pc_pathways.py <datasource> <format> `

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