NCMIR的命令行工具集
ncmirtools的Python项目详细描述
ncmirtools
用于与内部托管在NCMIR的数据交互的命令行工具集。
有关更多信息,请访问我们的wiki页面:
https://github.com/CRBS/ncmirtools/wiki
工具
- mpidir.py–给定一个microscopy产品id,此脚本将查找文件系统上的路径
- projectdir.py–给定一个项目id,此脚本将查找文件系统上的路径
- projectsearch.py–允许调用者在数据库中搜索项目
- mpidinfo.py–查询数据库并返回有关特定显微镜产品的信息
- imagetokiosk.py–通过scp将第二年轻的图像文件传输到远程服务器
- ncmirtool.py–很快将成为上面所有命令的主要入口点的新工具。目前提供将数据上传到细胞图像库(CIL)的原型
兼容性
- 应该在Linux发行版上的Python2.7、3.3、3.4和3.5上工作
安装
尝试下列操作:
pip install ncmirtools python setup.py install
许可证
虫子
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学分
这个包是用Cookiecutter和audreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。
历史记录
0.5.2(2018-04-02)
- 问题18的另一个解决方案是路径输出到标准 输出的路径分隔符输出不正确。
0.5.1(2018-04-02)
- 为上载设置分隔符以处理上载问题 来自Windows计算机的文件。 Issue #18
0.5.0(2018-03-28)
0.4.0(2017-06-28)
0.3.0(2017-01-13)
0.2.0(2016-11-8)
- 添加了projectdir.py脚本,用于查找给定目录 项目编号:问题3
- 添加了projectsearch.py脚本,该脚本将搜索给定的字符串 一个postgres数据库,用于名称中包含该字符串的项目 或描述。
0.1.1(2016-10-14)
- 对readme.rst进行了一些小的改进,以便更好地介绍pypi
0.1.0(2016-10-04)
- 带有单个脚本mpidir.py的初始版本