软件包,识别原始信号在两种情况下的变化https://github.com/jts/nanopolish重新调整了dRNASeq数据。

nanocompore的Python项目详细描述


Nanocompore


GitHub licensePythonBioRxiv

PyPI versionDownloadsBuild Status


nanomcompore通过比较2个样本来识别与RNA修饰相对应的ONT纳米孔测序原始信号的差异

nanomcompore比较了来自不同实验条件的2-ONT纳米孔直接RNA测序数据集,预期这些数据集对RNA修饰有显著影响。建议每个条件至少有2个重复。例如,可以使用具有显著减少修饰次数的控制条件,例如修饰写入酶被敲除或敲除的细胞系。或者,可以在较小规模上在体外合成感兴趣的转录本。在

完整文档可在http://nanocompore.rna.rocks

Nanocompore

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主要作者

  • 汤玛索·莱昂纳迪-汤姆{at}特莱奥在
  • 阿德里安·莱格-亚历格{at}英国息税折旧及摊销前利润在

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