心脏细胞电生理学的简单接口
myokit的Python项目详细描述
Myokit是一个基于open-sourcepython的工具包,有助于心脏细胞电生理的建模和模拟。 它在GitHub上托管,在PyPi上可用。 有关最新文档,请参见myokit.readthedocs.io。
有关myokit.org的更多信息,包括示例和安装指南。
安装
要安装myokit,请运行
pip install myokit
在Linux和Windows上,可以通过运行添加“开始”菜单图标
python -m myokit icons
要运行单单元模拟,必须安装CVODE(pip安装中包含windows二进制文件)。 此外,MyoKIT需要一个工作的C/C++编译器出现在系统上。
要使图形部分(如IDE)正常工作,还需要安装Pyqt4、Pyqt5或PySide(还不支持PySide2)。
现有的MyoKIT安装可以使用
升级pip install --upgrade myokit
有关详细信息,请参见http://myokit.org/install。
快速入门指南
安装后,要快速测试myokit是否工作,请键入
python -m myokit run example
或者干脆
myokit run example
要打开IDE窗口,请键入
myokit ide
要查看myokit还能做什么,请键入
myokit -h