跨多个样本和工具创建聚合生物信息学分析报告
multiqc的Python项目详细描述
multiqc是一个工具,可以将多个样本的生物信息学结果聚合到一个报告中。它是用python编写的,包含大量通用生物信息学工具的模块。
您可以从pypi安装multiqc,如下所示:
pip install multiqc
那么这只是一个转到分析目录并运行脚本的情况:
multiqc .
multiqc将扫描指定的目录('.'
是当前目录)并生成一个报告,详细说明它找到的任何内容。
默认情况下,报表是在multiqc_report.html
中创建的。在multiqc_data/
中创建制表符分隔的数据文件,以便为后续处理提供方便的访问。
有关更详细的说明,请运行multiqc -h
有关文档和教程视频,请参见multiqc网站:http://multiqc.info
multiqc由phil ewels(http://phil.ewels.co.uk)在瑞典sciliflab(http://www.scilifelab.se)撰写