跨多个样本和工具创建聚合生物信息学分析报告

multiqc的Python项目详细描述


multiqc是一个工具,可以将多个样本的生物信息学结果聚合到一个报告中。它是用python编写的,包含大量通用生物信息学工具的模块。

您可以从pypi安装multiqc,如下所示:

pip install multiqc

那么这只是一个转到分析目录并运行脚本的情况:

multiqc .

multiqc将扫描指定的目录('.'是当前目录)并生成一个报告,详细说明它找到的任何内容。

默认情况下,报表是在multiqc_report.html中创建的。在multiqc_data/中创建制表符分隔的数据文件,以便为后续处理提供方便的访问。

有关更详细的说明,请运行multiqc -h

有关文档和教程视频,请参见multiqc网站:http://multiqc.info

multiqc由phil ewels(http://phil.ewels.co.uk)在瑞典sciliflab(http://www.scilifelab.se)撰写

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
主类中的java访问方法   Javalog4j不读取它的log4j。属性文件   雅加达ee通过Java(web应用程序)使用iText/任何其他使用现成数据的库生成PDF报告   lua使用java阅读TeamSpeak 3消息   将日期转换为BST java   java Spring引用ProxyFactoryBean中带有ref的protoyype bean   如何使java只打印一条带有if语句的消息   java如何通过JavaMail从雅虎服务器发送电子邮件?   使用百分比和BigDecimal的java测试   java如何对字符串数组排序   java验证器+MVC+REST::更新问题   java如何阻止eclipse如此频繁地挂起?   java从AsyncTask(片段内)访问TextView   IDEJava:制作可调整大小和拖动的组件