使用vasp和materials项目工具对接口进行高吞吐量分析
MPInterfaces_Latest_Test的Python项目详细描述
…图片：：https://travis-ci.org/henniggroup/mpinterfaces.svg？分支=主
…图片：：https://codecov.io/gh/henniggroup/mpinterfaces/coverage.svg？branch=master
mpinterfaces是一个python包，它可以使用
vasp对任意材料界面（二维
材料、异质结构、配体封端的
纳米粒子和溶剂存在下的表面）进行高通量密度
功能理论（dft）分析。_ Vaspsol、Lammps、MaterialsProject数据库以及它们的开源工具和一点ASE。_材料项目：https://github.com/materialsproject
…_ vassol:https://github.com/henniggroup/vassol
…_ VASP:http://www.vasp.at/
。_工具：https://github.com/materialsproject
…_ lammps：http://lammps.sandia.gov/
…_ ase:https://wiki.fysik.dtu.dk/ase/
…图片：：https://github.com/henniggroup/mpinterfaces/blob/master/docs/mpinterfaces logo.png
：宽度：75%
：对齐：中心
使用miniconda设置虚拟环境
，可以按照https://conda.io/miniconda.html中的说明安装miniconda
Mac OS和Linux
BR/>源激活NoYuy环境NAMEXY
BR/> $CONDA安装NUMPY SCIPY MatPultLIPIPython
BR/> Windows：：BR/> BR/> $激活YouYuyEngult
注释：您需要安装C++库BR/>正确安装Buffe用于包安装纠正在Windows上。
出于教学和演示目的，我们建议使用Microsoft Azure笔记本，
一个示例位于https://notebooks.azure.com/joshgabriel92/libraries/pourbaix course
，其中包含两个笔记本，演示如何动态安装Pymatgen和Pyhull
数据科学教程。我们有一个笔记本feoh_example.ipynb用于pourbaix图和一个mpinterfacesdemo，它展示了mpinterfaces代码的其他特性，还有更多的特性。
对于带有linux操作系统的超级计算机集群，注意：
hipergator2和其他基于linux的超级计算集群已经共享了模块之一是GCC下的C++模块。BR/>在上述任何
GCC/5.2.0中都有需要加载的所有共享库
需要成功安装。
BR/>在创建BR/> MICONDA环境之前，请在HiPrgAt2上执行以下操作：
BR/>$module purge
$module load gcc/5.2.0
从pypi中获取稳定的发行版
ommend installing from pypi with:
$pip install mpinterfaces_latest
获取最新的bleeding edge版本
--------
如果您想开发和贡献我们建议从github存储库获取bleeding
副本。
如果已经有本地副本，则可以跳过以下说明的步骤1和2
。只需从mpinterfaces文件夹中执行"git pull"，然后转到
步骤3（如果本地副本是以开发模式安装的，也可以跳过此步骤）。
注意：在您自己的计算机上使用虚拟环境时，我们建议使用miniconda。
1。从github克隆最新版本
-git克隆https://github.com/henniggroup/mpinterfaces.git
2。CD接口
>3。python setup.py安装（或开发）
4.将mpint_config.yaml文件从config_files/mpint_config.yaml
复制到mpinterfaces/mpint_config.yaml
并更新文件，使您具有以下环境变量：
-mapi_key=the_key_get_from_materialsproject
-pmg_vasp_psp_dir=path_to_vasp_potcar_files
http://pymatgen.org/获取pymatgen
documentation
=对于所有结构操作任务，最好从这里开始：
http://pymatgen.org/使用pymatgen
examples文件夹包含一些示例脚本，演示了MPinterface和MaterialsProject包的使用。有关基本的
用法，请参阅**docs/usage.rst**。
_ MPinterfaces-paper:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s092702561630244
许可证
==
eReby免费授予获得本软件和相关文档文件（以下简称"软件"）副本的任何人，以无限制地使用本软件，包括但不限于使用、复制、修改、合并、发布、分发、再许可的权利。SE和/或出售
软件的副本，并允许向其提供软件的人员这样做，
但须遵守以下条件：
软件。
软件按"原样"提供，无任何明示或暗示的保证，包括但不限于对适销性、适用性和非侵权性的保证。在任何情况下，作者或
版权所有人均不对任何索赔、损害或其他责任负责，无论是在合同诉讼、侵权诉讼或其他诉讼中，因
与软件或软件的使用或其他交易有关，或因
与软件或软件的使用或其他交易有关而引起的。
=
=
>我们试图遵循pymatgen（pep8）所使用的编码风格：
阿鲁尼马辛格
<
约书亚·T·保罗
…图片：：https://codecov.io/gh/henniggroup/mpinterfaces/coverage.svg？branch=master
mpinterfaces是一个python包，它可以使用
vasp对任意材料界面（二维
材料、异质结构、配体封端的
纳米粒子和溶剂存在下的表面）进行高通量密度
功能理论（dft）分析。_ Vaspsol、Lammps、MaterialsProject数据库以及它们的开源工具和一点ASE。_材料项目：https://github.com/materialsproject
…_ vassol:https://github.com/henniggroup/vassol
…_ VASP:http://www.vasp.at/
。_工具：https://github.com/materialsproject
…_ lammps：http://lammps.sandia.gov/
…_ ase:https://wiki.fysik.dtu.dk/ase/
…图片：：https://github.com/henniggroup/mpinterfaces/blob/master/docs/mpinterfaces logo.png
：宽度：75%
：对齐：中心
使用miniconda设置虚拟环境
，可以按照https://conda.io/miniconda.html中的说明安装miniconda
Mac OS和Linux
BR/>源激活NoYuy环境NAMEXY
BR/> $CONDA安装NUMPY SCIPY MatPultLIPIPython
BR/> Windows：：BR/> BR/> $激活YouYuyEngult
注释：您需要安装C++库BR/>正确安装Buffe用于包安装纠正在Windows上。
出于教学和演示目的，我们建议使用Microsoft Azure笔记本，
一个示例位于https://notebooks.azure.com/joshgabriel92/libraries/pourbaix course
，其中包含两个笔记本，演示如何动态安装Pymatgen和Pyhull
数据科学教程。我们有一个笔记本feoh_example.ipynb用于pourbaix图和一个mpinterfacesdemo，它展示了mpinterfaces代码的其他特性，还有更多的特性。
对于带有linux操作系统的超级计算机集群，注意：
hipergator2和其他基于linux的超级计算集群已经共享了模块之一是GCC下的C++模块。BR/>在上述任何
GCC/5.2.0中都有需要加载的所有共享库
需要成功安装。
BR/>在创建BR/> MICONDA环境之前，请在HiPrgAt2上执行以下操作：
BR/>$module purge
$module load gcc/5.2.0
从pypi中获取稳定的发行版
ommend installing from pypi with:
$pip install mpinterfaces_latest
获取最新的bleeding edge版本
--------
如果您想开发和贡献我们建议从github存储库获取bleeding
副本。
如果已经有本地副本，则可以跳过以下说明的步骤1和2
。只需从mpinterfaces文件夹中执行"git pull"，然后转到
步骤3（如果本地副本是以开发模式安装的，也可以跳过此步骤）。
注意：在您自己的计算机上使用虚拟环境时，我们建议使用miniconda。
1。从github克隆最新版本
-git克隆https://github.com/henniggroup/mpinterfaces.git
2。CD接口
>3。python setup.py安装（或开发）
4.将mpint_config.yaml文件从config_files/mpint_config.yaml
复制到mpinterfaces/mpint_config.yaml
并更新文件，使您具有以下环境变量：
-mapi_key=the_key_get_from_materialsproject
-pmg_vasp_psp_dir=path_to_vasp_potcar_files
http://pymatgen.org/获取pymatgen
documentation
=对于所有结构操作任务，最好从这里开始：
http://pymatgen.org/使用pymatgen
examples文件夹包含一些示例脚本，演示了MPinterface和MaterialsProject包的使用。有关基本的
用法，请参阅**docs/usage.rst**。
_ MPinterfaces-paper:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s092702561630244
许可证
==
eReby免费授予获得本软件和相关文档文件（以下简称"软件"）副本的任何人，以无限制地使用本软件，包括但不限于使用、复制、修改、合并、发布、分发、再许可的权利。SE和/或出售
软件的副本，并允许向其提供软件的人员这样做，
但须遵守以下条件：
软件。
软件按"原样"提供，无任何明示或暗示的保证，包括但不限于对适销性、适用性和非侵权性的保证。在任何情况下，作者或
版权所有人均不对任何索赔、损害或其他责任负责，无论是在合同诉讼、侵权诉讼或其他诉讼中，因
与软件或软件的使用或其他交易有关，或因
与软件或软件的使用或其他交易有关而引起的。
=
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>我们试图遵循pymatgen（pep8）所使用的编码风格：
阿鲁尼马辛格
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约书亚·T·保罗
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