minepy-基于最大信息的非参数勘探
minep的Python项目详细描述
MePyy为最大信息提供了一个库 非参数勘探（mic和mine family）。主要功能：
- approx-mic（原始算法，doi:10.1126/science.1205438）和 mic_e（doi:arxiv:1505.02213和doi:arxiv:1505.02214）估计量；
- 总信息系数（tic，doi:arxiv:1505.02213）和 广义平均信息系数（gmic，doi:arxiv:1308.5712）；
- 一个ansi c库
- 高效的python api（python 2和3兼容性）；
- 一个高效的matlab/octave api；
minepy是一个开源的，gplv3许可的软件。
minervar接口位于CRAN。
微型工具
命令行应用程序`mine`自版本1.2.2以来已被弃用。 我们建议使用mictools，一个全面有效的tice和mice管道。 分析。TICE用于高效地执行高吞吐量 筛选所有可能的成对关系来评估 显著性，而小鼠被用来排列显著关联的子集 基于他们的力量。Paper， code and documentation。
Docker图像
minepy库预先安装在MICtools Docker image中。
引用minepy
戴维德·阿尔巴内塞，米歇尔·菲洛西，罗伯托·维辛塔纳，萨曼莎·里卡多纳， 朱塞佩·朱尔曼和塞萨尔·弗拉内洛。minerva和minepy: 我的套件及其r、python和matlab包装器。生物信息学（2013） 29（3）：407-408 2012年12月14日首次在线发布 doi:10.1093/生物信息学/bts707。
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