python包优化了两个多序列之间的相互信息对齐。
miga的Python项目详细描述
miga是一个python包,它提供msa(多序列比对)互信息遗传算法优化器。它以最大化或最小化它们的互信息的方式对两个MSA进行排序。遗传算法求解器可以在CPU和NVIDIA GPU上运行。
代码托管在GitHub。
许可证
- 本软件为版权所有
- 2018 Caio Silva Souza和文件作者中列出的所有作者,除非源文件中另有说明。
MIGA是根据LGPL软件许可证(版本3或更高版本)发布的。
联系人
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文档
请参阅代码库中的examples文件夹和online documentation以了解如何使用此包。
安装
有关安装说明,请参阅project page。