有助于生物地球化学和海洋微生物生态学研究的微生物生境建模框架。

microbenthos的Python项目详细描述


……图片::https://img.shields.io/pypi/v/microbenthos.svg
:目标:https://pypi.python.org/pypi/microbenthos

…图片:https://travis-ci.org/achennu/microbenthos.svg?branch=master
:目标:https://travis ci.org/achennu/microbenthos

…图片::https://readthedocs.org/projects/microbenthos/badge/?version=latest
:目标:https://microbenthos.readthedocs.io/en/latest/?徽章=最新
:alt:文档状态

…图片::http://joss.theoj.org/papers/5daae2e14258034d77cb694370cbae23/status.svg
:目标:http://joss.theoj.org/papers/5daae2e14258034d77cb694370cbae23
:alt:journal of open source software

microbenthos是一个用于研究底栖微生物系统的建模框架(python语言),例如微生物垫,海洋沉积物等。通过地球化学过程的计算模拟,使微生物的生态生理学和生物地球化学的硅化实验成为可能,
微生物代谢和质量传输物理。

*免费软件:麻省理工学院许可证
*文档:https://microbenthos.readthedocs.io
*源代码:https://github.com/achennu/microbenthos


模拟示例
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在您的模型中很容易包括微生物种群、太阳辐射、各向异性扩散等。

*科学家友好:
将本构化学和生物过程简单地定义为数学公式。数据以开放存档格式保存。


*动态可视化:
包括可实时查看的建模参数和结果的可视化,以及导出到视频的可视化。还显示了模拟的进度信息。

*有状态模拟:
模拟可以中断,然后继续,允许交互式检查和
省时。

*无需编程:
系统和行为可通过结构化文本文件定义。

*可扩展:
可以围绕定义的
结构通过简单编程创建微生物系统的新模式。










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