用于数字化和分析mimulus定位模式的cooley实验室工具

makeFlowerPolygons-dcthom的Python项目详细描述


花瓣

这个包是一组非常简单的python模块,cooley实验室 惠特曼学院正在分析含羞草花的斑点模式。 它仍然是非常在阿尔法,与许多错误。

它目前接受包含花卉图像矩阵的.csv文件。 可接受三种颜色:

照片背景色=0 花瓣颜色=2 专色=3

图像矩阵最初必须“融化”为三列,X、Y和颜色。 然后提供的函数将其解析为两个图像矩阵,一个用于花瓣形状 一个是花瓣轮廓。这些新图像保存为 将下游数字化为shapely package类的多边形。 或者,您可以从已经制作的spot和petal csv开始。

文档正在开发:

https://nbviewer.jupyter.org/github/danchurch/mimulusSpeckling/blob/master/make_polygons/notebooks/petals_to_polygons.ipynb

有关软件包使用的问题,请联系:thomasdc@whitman.edu

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