Python包分析和准备用于分子模拟的化合物库。
lib-prep的Python项目详细描述
#LibPrep公司 Python包分析和准备用于分子模拟的化合物库。在
家属 -Python 3.7 -Rdkit 2019.03.4 -薛定谔2019(可选)
#可用程序 ##转换\u sdfs2pdb.py公司 将含有大量分子化合物的3D-SDF文件转换为几个pdb的程序,并将链、resname和resnum重命名为所需的。在
用法示例:
python convert_sdfs2pdb.py公司图书馆.sdf–out_folder library_in_pdb–链L–resname LIG–resnum 1
更多信息:
python convert_sdfs2pdb.py公司-h
碎片工具/准备_碎片 从PDB库准备FragPELE指令的程序。在
使用示例:
python碎片工具/准备_碎片/路径/到/库/路径/到/复杂.pdbC1-m第一次出现-o/out/path/指令.conf在
更多信息:
python碎片工具/准备_碎片-h
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