我们实验室用于计算生物物理的实用程序集合

klab的Python项目详细描述


Klab-Korteme实验室工具库
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我们实验室用于计算生物物理的实用程序集合,包括PDB解析、SGE群集提交脚本,以及与Rosetta高分子软件套件的接口。


但是,模块内的代码应该遵循一致的约定。最后,请不要根据您的喜好重新格式化其他开发人员创建的模块。

这里有一些半标准的指导原则:

-一般规则:PEP 8惯例(https://www.python.org/dev/peps/pep-0008/)最为合理。
-空行:请参阅PEP 8中的“空行”。特别是,用两个空行包围顶级函数和类定义。
-行长度:直到模块创建者程序员。
-空白:使用空格而不是制表符,缩进设置为4个空格。请随意使用带有偏见的标签缩进。
-导入顺序:首先导入标准python包(sys,os),然后导入更高级别/附加包(sqlalchemy,numpy),然后导入我们的其他包(klab),然后导入此包(kddg)。在导入的每个部分之间换行。
-自然语言:请不要在外来模块中引入压缩,除非这是该模块的常见用法。

使用:

不使用ssh:

pip安装--user-e git+https://github.com/korteme lab/klab.git\egg=klab

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