keggstand 0.0.7

用法

要使用API客户端，请实例化一个新实例：

client = Kegg(cache=True)

在KEGG中列出生物代码：

列出给定有机体的可用途径材料和名称：

accessions = client.list_pathways(organism='hsa')

要将一个特定的路径解析成蛋白质-蛋白质相互作用的数据框架，可以通过KEGG路径 加入以下方法：

pathway = client.get_pathway(pathway='path:hsa01521')

# Inspect individual protein/genes parsed from XML file
pathway.entries

# Inspect relations between entries parsed from XML file
pathway.relations

# Pandas DataFrame of interactions with annotated post-translational modifications
pathway.interactions

要调用登录映射服务，可以将源数据库转换为目标数据库 数据库：

client.convert(source='hsa', destination='uniprot')

这将创建KEGG hsa标识符到uniprot swissprot标识符的映射。在

学分

此包是用Cookiecutter和audreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。在