推理器:网络推理

inferelator的Python项目详细描述


推理机

Traviscodecov

python的inferator包;当前不活动的inferelator_ng存储库的一个分支,可用于单细胞和大量转录体实验。目前包括AMuSR(Castro et al 2019)InfereCLaDR(Tchourine et al 2018)的元素。

要安装推理程序所需的python包,请运行pip install -r requirements.txt。要安装inferelator多处理功能所需的python包,请运行pip install -r requirements-multiprocessing.txt。要安装此软件包,请运行python setup.py install

教程中包括bacillus subtilissaccharomyces cerevisiae的基本工作流。

ZenodoDOI提供了所有当前示例数据和脚本

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