基于网络sim的尖峰事件lfps计算方法
hybridLF的Python项目详细描述
模块hybridlfpy
python模块实现一种混合模型方案，用于预测 尖峰的细胞外电位（局部场电位，lfps） 神经元网络模拟。
发展
模块杂交主要是在计算神经科学中发展起来的。 数学科学和 挪威生命大学的技术（http://www.nmbu.no/imt） 科学（http://www.nmbu.no），AAS，挪威，与 神经科学与医学（INM-6）和高级模拟研究所（IAS-6） 朱利希研究中心和贾拉，朱利希，德国 （http://www.fz-juelich.de/inm/inm-6/EN/）。
手稿
我们在hybridLFPy中实现的混合方案手稿的预印本可以在arxiv.org上的http://arxiv.org/abs/1511.01681
引用： 埃斯彭·哈根、大卫·达赫曼、玛丽亚·L·斯塔夫里诺、亨里克·林登、汤姆·泰茨拉夫、莎莎·詹妮弗·范阿尔巴达、索尼娅·格鲁恩、马库斯·迪斯曼、高特·T·艾内沃尔。用点神经元网络模拟局部场电位的混合方法。arxiv:1511.01681[q-bio.nc]
Bibtex来源：
@ARTICLE{2015arXiv151101681H,
author = {{Hagen}, E. and {Dahmen}, D. and {Stavrinou}, M.~L. and {Lind{\'e}n}, H. and
{Tetzlaff}, T. and {van Albada}, S.~J. and {Gr{\"u}n}, S. and
{Diesmann}, M. and {Einevoll}, G.~T.},
title = "{Hybrid scheme for modeling local field potentials from point-neuron networks}",
journal = {ArXiv e-prints},
archivePrefix = "arXiv",
eprint = {1511.01681},
primaryClass = "q-bio.NC",
keywords = {Quantitative Biology - Neurons and Cognition},
year = 2015,
month = nov,
adsurl = {http://adsabs.harvard.edu/abs/2015arXiv151101681H},
adsnote = {Provided by the SAO/NASA Astrophysics Data System}
}
教程幻灯片
ocns 2015年会议教程T2: Modeling and analysis of extracellular potentials的幻灯片，在捷克共和国布拉格举办，主题是lfpy和hybridlfpy：CNS2015_LFPy_tutorial.pdf
许可证
此软件在通用公共许可下发布（请参阅许可文件）。
保修
这个软件没有任何形式的保证。
安装
首先使用^{tt3}下载所有hybridLFPy源文件$ （http://git-scm.com）。打开终端窗口并键入：
cd $HOME/where/to/put/hybridLFPy git clone https://github.com/INM-6/hybridLFPy.git
若要在不安装文件的情况下使用任何工作文件夹中的hybridLFPy，请添加以下内容 指向$PYTHONPATH的路径。编辑您的.bash_profile或类似文件，并添加：
export $PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/PATH/TO/THIS/FOLDER:
也可以安装，但不建议安装，因为 来自存储库的任何请求：
(sudo) python setup.py install (--user)
示例文件夹
有关如何使用此模块的一些示例脚本
文档文件夹
使用sphinx自动生成文档的源文件。
要使用sphinx编译此目录中的文档源文件，请使用：
sphinx-build -b html docs documentation
在线文档
sphinx生成的html文档可以在 http://INM-6.github.io/hybridLFPy
欢迎加入QQ群-->： 979659372
