用于Jupyter实验室笔记本的HDF查看器
hdfviewer的Python项目详细描述
概述
hdfviewer是一个python3包，用于在jupyter lab笔记本的上下文中检查hdf文件。
。概述开始
它将HDF文件中的每个组表示为由以下子项组成的手风琴：
- attributes：包含此组的hdf属性
- 组：包含此组的hdf子组
- 数据集：包含此组的hdf数据集
如果其中一个子项为空（例如，没有为给定组定义属性），则忽略相应的子项。 当一个到达hdf数据集时，有关该数据集的信息被收集（维度、数字类型、属性…）并显示在jupyter输出小部件中。对于1D、2D或3D数据集，也会显示数据集的视图。根据数据集的维度，显示将包括：
- 1d：简单matplotlib 1d绘图
- 2d：数据集的矩阵视图
- 3d：数据集的矩阵视图
在2d和3d数据集的情况下，矩阵视图由数据集的选定帧的2d图像（对于2d数据集总是0）组成，数据集的1d列投影视图在其顶部，数据集的1d行投影视图在其右侧。矩阵视图与以下交互交互交互：
2d：
- 在交叉和集成1D封装模式之间切换。在交叉打印模式下，1D投影视图表示resp。用户左键单击的矩阵图像点的行和列。在集成打印模式下，1D投影视图表示resp上的和。图像的行和列。要在这两种模式之间切换，请按i键。
3d：
- 在交叉和集成1D封装模式之间切换。见上文。
- 按pgdn键转到最后一帧。
- 按pgup键转到第一帧。
- 按向下键或向右键或按向下键鼠标滚轮
- 按向上或向左键或按向上鼠标向下
- 按n数字，然后按down或right键，转到+n（n可以是>；9）帧
- 按n数字后跟up或left键，转到-n（n可以是>；9）帧
。概述结束
笔记本中的用法
。使用开始
。代码块：：python ：caption:笔记本中的用法
%matplotlib ipympl
import h5py
from hdfviewer.widgets.HDFViewer import HDFViewer
from hdfviewer.widgets.PathSelector import PathSelector
path = PathSelector(extensions=[".hdf",".h5",".nxs"])
path.widget
if path.file:
hdf5 = h5py.File(path.file,"r")
display(HDFViewer(hdf5))
。使用结束
预申请站点
- Python3+pip
安装
有关补充信息，请参见here <https://github.com/jupyter-widgets/ipywidgets/tree/master/packages/jupyterlab-manager>
cd指向存放setup.py文件的目录- pip3安装——用户。
故障排除
在jupyterlab上运行小部件可能会得到一些描述小部件的文本，而不是实际的小部件。这意味着您可能必须安装
jupyterlab-manager和jupyter-matplotlib扩展。要检查此项，请运行以下命令：
jupyter labextension list
如果没有或只提到其中一个扩展，请运行以下命令安装缺少的扩展：
jupyter labextension install @jupyter-widgets/jupyterlab-managerjupyter labextension install jupyter-matplotlib
欢迎加入QQ群-->： 979659372
