人脑药物计划中的全文BEL知识
hbp-knowledge的Python项目详细描述
HBP知识
此存储库包含以生物表达语言（BEL）保存的知识 为人类大脑药理学（HBP）项目。
Installation• Usage• Contributing• License
内容
- hbp_knowledge：此文件夹包含已存档的BEL文档。大多数是按类别（感兴趣的蛋白质、感兴趣的生物过程、途径等）组织的。amost-bel文档对应于单个出版物，但由于基于主题的管理，一些选定的出版物包含多个出版物中的内容。
- docs：此文件夹包含自动生成的HTML内容摘要，这些内容最好通过https://pharmacome.github.io/knowledge访问。
- notebooks：此文件夹包含与存储库关联的各种Jupyter笔记本由于其中许多使用pybel jupyter，因此最好使用NBViewer查看它们。
安装
hbp_knowledge可以使用以下命令从PyPI安装：
$ pip install hbp_knowledge
或者最新版本可以从GitHub安装，使用：
$ pip install git+https://github.com/pharmacome/knowledge.git
用法
图形可以加载：
fromhbp_knowledgeimportget_graphsfrompybelimportunion# Get all graphsgraphs=get_graphs()# Combine them all using pybel.uniongraph=union(graphs.values())
贡献
欢迎投稿！请将所有请求提交到https://github.com/pharmacome/knowledge
许可证
- 此存储库中的BEL脚本在CC B4.0许可下获得许可
- 此存储库中的python源代码是根据mit许可证授权的。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
