基于高斯过程的采样图像分割
gpssi的Python项目详细描述
gpssi公司
此存储库为论文提供代码:
医学影像分析34(2016):42-51。doi:10.1016/j.media.2016.04.005
请注意,这不是作者的正式实现,其动机是缺乏公开可用的代码。 请注意,可能与原始实现有所不同。在
实施细节
测地图
为了生成测地图,这个项目依赖于GeodisTK包。此软件包可以通过pip或 源代码(https://github.com/taigw/GeodisTK)。由于安装时观察到的问题 通过pip的包,我们建议从github链接安装它(参见installation)。在
因子分解通过Kronecker
作者使用协方差矩阵的Kronecker矩阵表示来克服协方差矩阵大的问题。在
本项目基于以下参考文献实现kronecker矩阵向量积:
- Saatçi,尤努斯。结构化高斯过程模型的可伸缩推理。Diss公司。剑桥大学,2012年。
- Gilboa、Elad、Yunus Saatçi和John P.Cunningham。”结构化高斯过程的标度多维推理〉《模式分析与机器智能IEEE汇刊》37.2(2013):424-436。
安装
此项目作为python包提供,可以由
pip install gpssi
否则,该包也可以从源代码通过
git clone https://github.com/alainjungo/gpssi.git
cd gpssi
pip install .
GeodisTK包不是自动安装的,必须手动安装。 我们建议通过源代码直接安装:
^{pr2}$或者,您可以尝试从pypi(pip install GeodisTK
)安装它
使用
有关用法示例,请参见gpssi_example.py。在
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