从命令行/python将gpml路径标记呈现到svg。

gpml2svg的Python项目详细描述


gpml2svg是一个命令行和python api,用于将使用gpml(genmapp pathway markup language)标记的路径转换为svg。命令行界面目前是基本的。只需使用要转换的gpml文件的名称调用脚本。生成的SVG将使用相同的名称保存,扩展名更改为.svg。生成的svg用对象标识符标记,并链接到相关数据库。python接口提供了一个单独的函数调用,您可以选择为自定义外部参照提供着色信息(用于数据可视化)和链接。软件作为metapath的扩展正在开发中。

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