用于操作序列的galaxy实用程序galaxy项目。
galaxy_sequence_utils的Python项目详细描述
星系序列
galaxy的sequence实用程序是一组python模块,用于读取、分析和转换序列格式。
这个包可以安装到任何一个带有工具库的galaxy中:https://toolshed.g2.bx.psu.edu/view/devteam/package_galaxy_utils_1_0
galaxy包本身被维护在https://github.com/galaxyproject/tools-devteam/tree/master/packages/package_galaxy_utils_1_0
历史记录
1.1.3(2018-07-06)
- 在fastaWriter和^{tt3}中处理默认的format=None。$ Pull Request 16
1.1.2(2017-10-05)
- 不要在fastqNamedReader类中打开压缩文件两次 Pull Request 15
1.1.1(2017-09-19)
- 修复fastq_filter.py、fastq_masker_by_quality.py、fastq_stats.py和 fastq_to_fasta.py包装脚本 Pull Request 14
- 修复fastq_filter.py包装脚本 Pull Request 13
1.1.0(2017-02-13)
- 支持gz和bzip2压缩文件。 Pull Request 11
- 将galaxy工具的包装脚本移动到此项目中,并作为 安装程序.py。 Pull Request 11
1.0.2(2017-02-02)
- 将通用galaxyproject模板应用于python结构。5e9bfc0
- 合并核心galaxy项目中的pep-8和python 3补丁 @恩桑佐。 Pull Request 4
- 实施项目测试。a9b907c
- 向pypi发布了第一个版本。
1.0.1(2015-12-10)
- 允许fastqjoiner接受要在连接对之间使用的基字符串。 Pull Request 2
1.0.0(2015-10-30)
- 从Galaxy提取的初始导入,用于为 工具棚里的工具。
- 使用设置工具 Pull Request 1