从Freesurfer分割文件中提取roi的CLI工具
FSMakeRO的Python项目详细描述
FSMakeROI公司
一个CLI工具,用于将自由曲面分段转换为单独的NifTi 文件
安装
使用pip
安装此软件包:
pip install fsmakeroi
使用
运行此工具的命令上下文是:
^{pr2}$其中aseg
是指向aparc的路径+aseg.mgz公司文件,rois
是
包含Freesurfer ROI LUT代码的文本文件的路径。在
ROI代码文件是要提取的ROI列表,每行 代码对应ROI。请参考 /示例/示例_rois.txt文件有关创建代码文件的示例。在
roi也可以应用于任何图像,只要它们被注册
到T1在自由曲面空间。这是用-i
或--image
完成的
标志:
fsmakeroi -i [PATH TO IMAGE] aseg rois
- 项目
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