用于python的firebrowse门户api绑定
firebrowse的Python项目详细描述
说明
FireBrowse:Broad Institute TCGA GDAC FireBrowse门户的Python绑定。
此模块有助于与TCGA数据进行编程交互,并在 firebrowse.org,通过python和unix命令行。它提供3套 功能:
1)底层面向对象的python包装器到firebrowse restful api。 默认情况下,低级接口中的方法返回每个 以json形式调用。tsv、csv和python dict可以通过指定 合适的格式=参数,可以使用合适的 page=参数。有关详细信息,请参见set_codec()和param_values()函数 有关这些参数和其他参数的详细信息。
2)一个更高级别的python接口,为公共 生物信息用例。例如,对象不需要显式地 在默认情况下,实例化和函数根据 以TSV格式调用。
3)和FBGET工具,用于直接从 unix命令行。
有关详细信息、文档和示例,请参见
https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/fbget
发行说明
发布说明可在firebrowse.org上找到,从
https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/FireBrowse+Release+Notes
有关消防软管数据和分析运行的说明,请访问
https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/Analysis+Run+Release+Noteshttps://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/Standardized+Data+Run+Release+Notes