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fijitools的Python项目详细描述
作者：弗拉基米尔·施泰恩
github：[github]（https://github.com/mistervladimir）
linkedin：[linkedin]（https://www.linkedin.com/in/vladimir-shteyn/）
简介
fijitools是一个用于处理fiji/imagej roi数据的python api。
功能
roi i/o：读取以.zip格式保存的imagej/fiji感兴趣区域（roi）数据。整个.zip文件中的roi bytestream数据作为单个numpy数组一起解析，并发送到特定于每个roi类型的类。目前所有的roi都可以被读取，但是只有矩形和椭圆的roi对象被写入。python roi实例可以转换回imagej/fiji bytestreams，保存为.zip文件，并由imagej/fiji读取。这是一项正在进行的工作。
csv解析：使用正则表达式过滤由roimanager->；多度量工具生成并保存为csv文件的imagej/fiji数据。
方便函数：各种数据结构和函数，使生活更轻松。用于管理解析的imagej/fiji数据的专用数据结构。
待办事项
roi i/o：将文本roi写入imagej/fiji bytestreams并将其保存为.zip文件。有了这个特性，最初由python api生成的矩形或椭圆形roi可以在imagej/fiji中用text labels可视化。如果我们想在对分割算法进行故障排除的同时检查roi数据，这尤其有用。
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