Extasy项目-包装
extasy.wrappers的Python项目详细描述
#extasy wrappers是一个库，用于简化extasy仿真分析工作流的构建。
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**extasy wrappers*为从python脚本启动命令行应用程序（如md模拟或模拟分析作业）提供了一致的api。尽管最初设计时考虑了extasy仿真分析工作流，但它们可以扩展到许多其他可能的应用程序。
简而言之，一个完整的模拟或分析作业的构造和执行被简化为一个python函数调用，其形式为：
````
`！！python
results=kernel.run（inputs）
````
其中“kernel”可能是pmemd、grompp、pycoco、lsdmap等。
有关详细信息，请参见wiki。
*0.0.1版
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*克隆存储库，然后运行setup.py:
```
git clone https://bitbucket.org/extasy project/wrappers.git
cd wrappers
python setup.py install--user
````
*依赖项：*extasy wrappers*本身在标准python库之外没有依赖项。要运行这些示例，需要：
1。MD代码：琥珀色（或Ambertools）和/或扣环
2。采样分析包：[extasy coco]（https://bitbucket.org/extasy-project/coco）和/或[extasy兼容的lsdmap]（https://github.com/clementigroup/lsdmap）
运行并行示例还需要：
[dask]（https://github.com/blaze/dask）和/或[mpipool]（https://github.com/adrn/mpipool/tree/master/mpipool）
*如何运行测试：请参阅./examples下文件夹中的自述文件。
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*查理·劳顿
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**extasy wrappers*为从python脚本启动命令行应用程序（如md模拟或模拟分析作业）提供了一致的api。尽管最初设计时考虑了extasy仿真分析工作流，但它们可以扩展到许多其他可能的应用程序。
简而言之，一个完整的模拟或分析作业的构造和执行被简化为一个python函数调用，其形式为：
````
`！！python
results=kernel.run（inputs）
````
其中“kernel”可能是pmemd、grompp、pycoco、lsdmap等。
有关详细信息，请参见wiki。
*0.0.1版
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*克隆存储库，然后运行setup.py:
```
git clone https://bitbucket.org/extasy project/wrappers.git
cd wrappers
python setup.py install--user
````
*依赖项：*extasy wrappers*本身在标准python库之外没有依赖项。要运行这些示例，需要：
1。MD代码：琥珀色（或Ambertools）和/或扣环
2。采样分析包：[extasy coco]（https://bitbucket.org/extasy-project/coco）和/或[extasy兼容的lsdmap]（https://github.com/clementigroup/lsdmap）
运行并行示例还需要：
[dask]（https://github.com/blaze/dask）和/或[mpipool]（https://github.com/adrn/mpipool/tree/master/mpipool）
*如何运行测试：请参阅./examples下文件夹中的自述文件。
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*查理·劳顿
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