评估有助于挑战管理员轻松地为grand-challenge.org创建评估容器。

evalutils的Python项目详细描述


评估值

https://badge.fury.io/py/evalutils.svghttps://travis-ci.org/comic/evalutils.svg?branch=masterMaintainabilityTest CoverageDocumentation StatusUpdateshttps://img.shields.io/badge/code%20style-black-000000.svg

评估有助于挑战管理员轻松地为grand-challenge.org创建评估容器。

功能

  • 使用Cookiecutter
  • 为grand-challenge.org生成、测试和导出Docker容器的脚本
  • 加载csv、itk和枕头兼容的预测文件
  • 验证提交的预测
  • scikit学习度量和pandas聚合的接口
  • 带Jaccard索引计算的边框批注

开始

evalutils需要python 3.6,可以从pip安装。拜托 有关详细信息,请参阅Getting Started文档。

学分

这个包是用Cookiecutteraudreyr/cookiecutter-pypackage项目模板创建的。

历史记录

0.1.17(2019-05-23)

  • 修复Windows上的生成和测试脚本
  • 使用scipy 0.21.1修复balltree执行

0.1.16(2019-02-13)

  • 修复了由于额外的}

0.1.15(2019-02-01)

  • Pins Pandas版本,因为在Pandas 0.24.0中存在将数据帧转换为字典的错误
  • 创建后将export.sh模板更新为gzip docker容器
  • 增加了Python3.7支持

0.1.14(2018-10-16)

  • 添加evalutils.stats以计算医学成像中的常用指标
  • 添加实验性Windows支持-我们没有所有Windows测试的CI,因此请报告任何错误
  • 添加用于计算引导roc曲线的evalutils.roc

0.1.13(2018-09-12)

  • 为项目生成器添加分段和检测挑战
  • 文件加载程序现在返回字典列表,而不是字典列表
  • 将联合上的交叉口重命名为Jaccard索引
  • 改进了图像内存管理。添加了io.imageloader和独立的加载图像散列图像函数。
  • score\u case不再是静态方法

0.1.12(2018-05-16)

  • 修正了一个错误,其中假阴性数可能小于0。

0.1.11(2018-05-15)

  • 中断更改:Evaluation重命名为ClassificationEvaluation
  • 添加对DetectionEvaluation
  • 的支持

0.1.10(2018-04-19)

  • 简化示例模板

0.1.9(2018-04-19)

  • 中断更改:BoundingBox()
  • 中将bb2重命名为other
  • ground_truth_path不再是必需的参数

0.1.8(2018-04-18)

  • 修复分发版中的模板文件夹

0.1.7(2018-04-18)

  • 添加用于生成新项目的CookiCutter模板
  • BoundingBox
  • 添加相等检查

0.1.6(2018-03-30)

  • 改进熊猫CSV处理

0.1.5(2018-03-30)

  • 更正某些csv文件的加载
  • 添加日志记录和更多测试
  • 在联接的pandas表中添加对_ground_truth_prediction的引用

0.1.3(2018-03-29)

  • 使用
    添加基本实现
    • 完整的评估工作流程
    • csv、simpleitk和imageio加载程序
    • 带交集、并集和交集的边框批注超联合度量
    • 唯一的文件索引、唯一的图像、预期的列名和案例数验证器

0.1.0(2018-03-22)

  • pypi上的第一个版本。

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