具有随机传染周期的流行病模型

epistoch的Python项目详细描述


书信会

https://img.shields.io/pypi/v/epistoch.svghttps://travis-ci.com/griano/epistoch.svg?branch=masterDocumentation Status

随机传染周期

这个软件允许你在传染期用一般随机分布来模拟流行病。在

传统的流行病学模型,如SIR,没有考虑长度的分布 传染期。在这个软件中,我们包括三个计算这些类型模型的函数 使用其他发行版。在

https://github.com/griano/epistoch/raw/master/docs/_static/DIVOC-SIR-comp.png

在这张图中,你可以看到,相对于SIR-G,常规SIR模型的预测有多大的不同 这实际上使用了一个更现实的传染期分布。 SIR-G病例感染高峰出现在发病前,且强度较大。 然而,最终被感染的人数在两种模型中保持不变

型号

  • SIR:经典SIR模型,具有(隐含)指数传染期。在
  • SIR_G:与经典的SIR模型一样,但是具有任意分布。在
  • SIR-PHG:一个具有阶段型分布的SIR模型。在
  • SEIRD:每个阶段具有hase型分布的SEIRD模型。在

注释

    文中解释了该方法的理论基础:{a8}。在
  • 文档:https://epistoch.readthedocs.io。在
  • 源代码:https://github.com/griano/epistoch。在
  • 免费软件:麻省理工学院许可证。软件按“原样”提供,不提供任何形式的担保, 明示或暗示,包括但不限于适销性保证, 特定目的的适用性和非侵犯性。在

历史

  • PyPI的第一个版本。在

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