divebomb潜水分类算法
divebomb的Python项目详细描述
divebomb
divebomb是一个python包，它使用pandas将深度的时间序列划分为单个潜水。潜水被描述为dive或deepdive
取决于动物。潜水类用于经常浮出水面的动物，如海豹和鲸鱼。"深海潜水"类用于不常见的浮出水面的动物，如鲨鱼。
利用主成分分析法将潜水剖面降为8维。Guassian混合模型是使用这些变量生成的 利用最小贝叶斯信息准则确定最优聚类数。跳水被分成若干组 聚集层次聚类（来自sklearn）。然后，这些数据将通过ipython笔记本显示或保存到按群集组织的netcdf文件中。
文档
官方文档位于此处：http://divebomb.readthedocs.io/en/latest/
跳水然后使用以下属性对adive进行分析：
最大深度-潜水中的最大深度潜水开始-潜水中第一个点的时间戳下潜结束-下潜最后一点的时间戳底端开始-动物到达深度时潜水中第一个点的时间戳td_bottom_duration-一个TimeDelta对象，包含动物在深度的持续时间（秒）td_下降持续时间-包含动物下降持续时间（秒）的TimeDelta对象td_ascent_duration-一个TimeDelta对象，包含动物上升的持续时间（秒）td_surface_duration-一个TimeDelta对象，包含动物在表面的持续时间（秒）底部方差-动物在下潜时深度的方差潜水方差-整个潜水深度的方差。下降速度-下降的平均速度上升速度-下降的平均速度峰值-潜水剖面中的峰值数左倾斜-一个1或0的布尔值，表示俯冲是否左倾斜向右倾斜-布尔值为1或0，表示俯冲是否向右倾斜无扭曲-一个1或0的布尔值，指示跳水是否没有扭曲
深潜
然后使用以下属性对adeepdive进行分析：
最大深度-潜水中的最大深度最小深度-潜水的最大深度潜水开始-潜水中第一个点的时间戳下潜结束-下潜最后一点的时间戳td_total_duration-包含潜水持续时间的时间增量（从1970-01-01开始以秒为单位）深度方差-整个潜水深度的方差。平均垂直速度-动物在整个潜水过程中的平均速度，负值表示向上运动平均下降速度-任何向下运动的平均速度为正值平均上升速度-任何上升运动的平均速度为正值下降次数转换-在潜水期间，动物移动的次数和距离下降任何距离上升过渡次数-在潜水期间，动物的移动次数和上升距离总下降距离e>-以米为单位的总绝对距离，在该距离内，卫星向下移动总上升距离潜水深度的总体变化-潜水期间最小深度和最大深度之间的差异td_time_at_depth-动物在垂直运动最深部分（85%深度）停留的时间（秒）td_time_pre_depth-垂直运动最深部分（85%深度）之前的持续时间（秒）td_time_post_depth-垂直运动最深部分（85%深度）后的持续时间（秒）峰值-潜水剖面中的峰值数左倾斜-一个1或0的布尔值，表示俯冲是否左倾斜向右倾斜-布尔值为1或0，表示俯冲是否向右倾斜无扭曲-一个1或0的布尔值，指示跳水是否没有扭曲
表面阈值
表面阈值用于在动物表面上定义被认为在表面的深度窗口。surface\u threshold参数默认为0，但可以在profile\u dive（）函数中更改。例如，对于长度~2米的动物，可能会传递surface\u threshold=2。表面阈值始终以米为单位。
深度阈值
深度阈值用于dive和deepdive类。参数是一个介于0和1之间的值，它决定了当一只动物被认为是在潜水的底部时的窗口。默认值为0.15这意味着相对深度的底部15%被认为位于底部。at_depth\u thresold始终为表示百分比的0和1之间的值。
倾斜被定义为dive类在下降或上升时间上的任何一种方式的差异，以及deepdive在深度前或深度后时间上的任何差异。选择这种方法是因为研究人员发现，当两个值之间存在任何差异时，偏斜的表示最为准确。
时间戳
输入时间戳应采用日期时间格式。从1970-01-01开始，输出时间戳以秒为单位。
每个netcdf文件都将时间单位保存为一个属性作为提醒。所有以td开头的潜水属性都是
以秒为单位的持续时间。时间、潜水开始、潜水结束和底部开始将使用上述单位。
netcdf4库有一个num2date函数，可以将值转换回datetime对象。
divebomb
divebomb是一个python包，它使用pandas将深度的时间序列划分为单个潜水。潜水被描述为dive或deepdive
取决于动物。潜水类用于经常浮出水面的动物，如海豹和鲸鱼。"深海潜水"类用于不常见的浮出水面的动物，如鲨鱼。
利用主成分分析法将潜水剖面降为8维。Guassian混合模型是使用这些变量生成的 利用最小贝叶斯信息准则确定最优聚类数。跳水被分成若干组 聚集层次聚类（来自sklearn）。然后，这些数据将通过ipython笔记本显示或保存到按群集组织的netcdf文件中。
跳水然后使用以下属性对adive进行分析：
最大深度-潜水中的最大深度潜水开始-潜水中第一个点的时间戳下潜结束-下潜最后一点的时间戳底端开始-动物到达深度时潜水中第一个点的时间戳td_bottom_duration-一个TimeDelta对象，包含动物在深度的持续时间（秒）td_下降持续时间-包含动物下降持续时间（秒）的TimeDelta对象
td_ascent_duration-一个TimeDelta对象，包含动物上升的持续时间（秒）td_surface_duration-一个TimeDelta对象，包含动物在表面的持续时间（秒）底部方差-动物在下潜时深度的方差潜水方差-整个潜水深度的方差。下降速度-下降的平均速度上升速度-下降的平均速度峰值-潜水剖面中的峰值数左倾斜-一个1或0的布尔值，表示俯冲是否左倾斜向右倾斜-布尔值为1或0，表示俯冲是否向右倾斜无扭曲-一个1或0的布尔值，指示跳水是否没有扭曲深潜
然后使用以下属性对adeepdive进行分析：
最大深度-潜水中的最大深度最小深度-潜水的最大深度潜水开始-潜水中第一个点的时间戳下潜结束-下潜最后一点的时间戳td_total_duration-包含潜水持续时间的时间增量（从1970-01-01开始以秒为单位）深度方差-整个潜水深度的方差。平均垂直速度-动物在整个潜水过程中的平均速度，负值表示向上运动平均下降速度-任何向下运动的平均速度为正值平均上升速度-任何上升运动的平均速度为正值下降次数转换-在潜水期间，动物移动的次数和距离下降任何距离上升过渡次数-在潜水期间，动物的移动次数和上升距离总下降距离-总绝对距离，单位为米，飞机向下移动总上升距离潜水深度的总体变化-潜水期间最小深度和最大深度之间的差异td_time_at_depth-动物在垂直运动最深部分（85%深度）停留的时间（秒）td_time_pre_depth-垂直运动最深部分（85%深度）之前的持续时间（秒）td_time_post_depth-垂直运动最深部分（85%深度）后的持续时间（秒）峰值-潜水剖面中的峰值数左倾斜-一个1或0的布尔值，表示俯冲是否左倾斜向右倾斜-布尔值为1或0，表示俯冲是否向右倾斜无扭曲-一个1或0的布尔值，指示跳水是否没有扭曲
表面阈值
表面脱粒机d用于在动物表面上定义被认为是在表面的深度窗口。surface\u threshold参数默认为0，但可以在profile\u dive（）函数中更改。例如，对于长度~2米的动物，可能会传递surface\u threshold=2。表面阈值始终以米为单位。
深度阈值
深度阈值用于dive和deepdive类。参数是一个介于0和1之间的值，它决定了当一只动物被认为是在潜水的底部时的窗口。默认值为0.15这意味着相对深度的底部15%被认为位于底部。at_depth\u thresold始终为表示百分比的0和1之间的值。
倾斜被定义为dive类在下降或上升时间上的任何一种方式的差异，以及deepdive在深度前或深度后时间上的任何差异。选择这种方法是因为研究人员发现，当两个值之间存在任何差异时，偏斜的表示最为准确。
时间戳
输入时间戳应采用日期时间格式。从1970-01-01开始，输出时间戳以秒为单位。
每个netcdf文件都将时间单位保存为一个属性作为提醒。所有以td开头的潜水属性都是
以秒为单位的持续时间。时间、潜水开始、潜水结束和底部开始将使用上述单位。
netcdf4库有一个num2date函数，可以将值转换回datetime对象。
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