描述流行病学的综合元回归框架
dismod-mr的Python项目详细描述
Introduction
这个项目是描述流行病学的元回归工具， 从全球疾病负担（gbd）研究中发展出来的dismod mr 2010年。已为卫生研究所开发了DISMOD MR 2008-2013年华盛顿大学的度量和评估。
Installation
dismod mr需要pymc2，它不能很好地与普通python一起工作 安装工具。幸运的是，conda为我们解决了这个问题。 所以首先你需要建立一个conda环境 （在installing conda, if necessary之后） 并安装pymc。然后可以使用pip安装dismod_mr。
conda create --name=dismod_mr python=3.6 pymc conda activate dismod_mr pip install dismod_mr
Installing from source
如果要以可编辑模式在本地安装dismod_mr，则 说明非常相似。我们将克隆存储库并安装它 从本地目录而不是使用pip从python中获取 包索引。
conda create --name=dismod_mr python=3.6 pymc conda activate dismod_mr git clone git@github.com:ihmeuw/dismod_mr.git cd dismod_mr pip install -e .
Coding Practices
- 在编写代码之前编写测试
- 在测试前编写公式
- 用模拟数据进行定量测试
- 用真实数据进行定性测试
- 自动化测试
- 使用包装而不是DIY
- 测试软件包
- 以后优化代码
- 在速度之前优化代码的可读性
- .py文件应短，少于500行
- 函数应短，少于25行
欢迎加入QQ群-->： 979659372
