一种用于dicom文件匿名化的工具
dicognito的Python项目详细描述
dicognito是一个匿名的Python模块和命令行实用程序 DICOM文件。
使用它可以匿名化一个或多个属于一个或多个患者的dicom文件。对象将保持分组 在他们最初的病人、研究和系列中。
包是available on pypi,可以通过键入
pip install dicognito
从命令行匿名化
安装后,一个dicognito
命令将添加到python脚本目录中。
您可以在整个文件系统树或glob指定的文件集合上运行它,就像这样:
dicognito . # recurses down the filesystem, anonymizing all found DICOM files
dicognito *.dcm # anonymizes all files in the current directory with the dcm extension
文件将被匿名化,具有重要属性,如标识符、名称和 地址,替换为随机值。日期和时间将随机移动,但是 文件内部和文件之间的顺序将保持一致。
通过dicognito --help
获取更多帮助。
在python中匿名化
要匿名化python程序中的一组dicom对象,请使用
pydicom并使用Anonymizer
类:
importpydicomimportdicognito.anonymizeranonymizer=dicognito.anonymizer.Anonymizer()fororiginal_filenamein("original1.dcm","original2.dcm"):withpydicom.dcmread(original_filename)asdataset:anonymizer.anonymize(dataset)dataset.save_as("clean-"+original_filename)
对可能是同一系列的一部分的数据集使用单个Anonymizer
,否则标识符将不是
跨对象一致。
徽标:从Radiology重新混合 由priyanka和Incognito由d͡ʒɛrmi Good从the Noun Project开始。