用于rlr分析管道的生物信息学和胶水工具
cobratools的Python项目详细描述
眼镜蛇工具
眼镜蛇实验室用于生物信息学的各种工具。
开始
这些说明将为您在本地计算机上启动和运行项目的副本,以便进行开发和测试。
先决条件
需要Python3.6或更高版本。所有其他要求都包含在requirements.txt
安装
一个循序渐进的示例系列,告诉您如何使开发环境运行
说出步骤
Give the example
然后重复
until finished
以从系统中获取一些数据或将其用于小演示为例结束
单元测试
使用
运行单元测试cd general
pytest -sv --cov-report term-missing --cov=models
起毛
用
cd general
pylint *.py models tests
请注意,pylint将所有模块级变量视为常量。
另外
cd general
flake8
类型检查
使用
mypy general/*.py general/tests general/models
贡献
请阅读此处的内容,了解向我们提交请求的详细信息和过程。
版本控制
关于这里的版本控制
作者
- clayton cafiero-initial work
另请参阅参与此项目的contributors列表。
许可证
此项目是在gplv3许可下授权的-有关详细信息,请参见LICENSE.md文件
PYPI
https://pypi.org/project/cobratools/