用于rlr分析管道的生物信息学和胶水工具

cobratools的Python项目详细描述


眼镜蛇工具

眼镜蛇实验室用于生物信息学的各种工具。

开始

这些说明将为您在本地计算机上启动和运行项目的副本,以便进行开发和测试。

先决条件

需要Python3.6或更高版本。所有其他要求都包含在requirements.txt

安装

一个循序渐进的示例系列,告诉您如何使开发环境运行

说出步骤

Give the example

然后重复

until finished

以从系统中获取一些数据或将其用于小演示为例结束

单元测试

使用

运行单元测试
cd general
pytest -sv --cov-report term-missing --cov=models

起毛

cd general
pylint *.py models tests

请注意,pylint将所有模块级变量视为常量。

另外

cd general
flake8

类型检查

使用

mypy general/*.py general/tests general/models

贡献

请阅读此处的内容,了解向我们提交请求的详细信息和过程。

版本控制

关于这里的版本控制

作者

  • clayton cafiero-initial work

另请参阅参与此项目的contributors列表。

许可证

此项目是在gplv3许可下授权的-有关详细信息,请参见LICENSE.md文件

PYPI

https://pypi.org/project/cobratools/

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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